RNA id: TCONS_00064104


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064104
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_032989
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 36733709 ~ 36733826 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGCATTATCCTTGTCACCCTGCAGCCTAAGACCggtcactcactgaagctaagcagagcttagcctggccagtacctggatgagagatcACAtcggaaaaactaggttgctgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117960

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065194 lncRNA downstream 105612 36621310 ~ 36628097 (-) True XLOC_032987
TCONS_00064099 lncRNA downstream 180962 36551736 ~ 36552747 (-) True XLOC_032986
TCONS_00065193 lncRNA downstream 340214 36386292 ~ 36393495 (-) True XLOC_032984
TCONS_00064095 lncRNA downstream 443084 36287538 ~ 36290625 (-) False XLOC_032983
TCONS_00065192 lncRNA downstream 443835 36287886 ~ 36289874 (-) True XLOC_032983
TCONS_00065195 lncRNA upstream 608502 37342328 ~ 37344594 (-) True XLOC_032992
TCONS_00064129 lncRNA upstream 1014729 37748555 ~ 37749697 (-) True XLOC_033005
TCONS_00065196 lncRNA upstream 1398685 38132511 ~ 38358080 (-) False XLOC_033006
TCONS_00065197 lncRNA upstream 2025720 38759546 ~ 38763847 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065198 lncRNA upstream 2025720 38759546 ~ 38764324 (-) False XLOC_033009
TCONS_00064098 mRNA downstream 180865 36551083 ~ 36552844 (-) False XLOC_032986
TCONS_00064092 mRNA downstream 535657 36127505 ~ 36198052 (-) False XLOC_032982
TCONS_00064093 mRNA downstream 551594 36131031 ~ 36182115 (-) False XLOC_032982
TCONS_00064085 mRNA downstream 954361 35675784 ~ 35779348 (-) False XLOC_032978
TCONS_00064086 mRNA downstream 994873 35675874 ~ 35738836 (-) True XLOC_032978
TCONS_00064107 mRNA upstream 36807 36770633 ~ 36795111 (-) True XLOC_032988
TCONS_00064108 mRNA upstream 655857 37389683 ~ 37403444 (-) True XLOC_032993
TCONS_00064109 mRNA upstream 675732 37409558 ~ 37422841 (-) True XLOC_032994
TCONS_00064110 mRNA upstream 697343 37431169 ~ 37441520 (-) True XLOC_032995
TCONS_00064113 mRNA upstream 717515 37451341 ~ 37460178 (-) False XLOC_032998
TCONS_00064097 other downstream 231379 36479193 ~ 36502330 (-) True XLOC_032985
TCONS_00064094 other downstream 535945 36178345 ~ 36197764 (-) True XLOC_032982
TCONS_00064091 other downstream 820202 35912621 ~ 35913507 (-) False XLOC_032980
TCONS_00064062 other downstream 1795002 34932623 ~ 34938707 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064105 other upstream 10308 36744134 ~ 36744251 (-) True XLOC_032990
TCONS_00064106 other upstream 36113 36769939 ~ 36770069 (-) True XLOC_032991
TCONS_00064111 other upstream 705429 37439255 ~ 37439370 (-) True XLOC_032996
TCONS_00064112 other upstream 713202 37447028 ~ 37447143 (-) True XLOC_032997
TCONS_00064119 other upstream 764320 37498146 ~ 37498856 (-) True XLOC_033000