RNA id: TCONS_00064123


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064123
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_033003
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 37615366 ~ 37615483 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAGCCATATTACACTGCAGCACAAGACTTTTtgcccactgaagccaagcagggtaGAGCCTGGCCAATACATGGATAAGAGACACTTgggggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119341

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065195 lncRNA downstream 270772 37342328 ~ 37344594 (-) True XLOC_032992
TCONS_00065194 lncRNA downstream 987269 36621310 ~ 36628097 (-) True XLOC_032987
TCONS_00064099 lncRNA downstream 1062619 36551736 ~ 36552747 (-) True XLOC_032986
TCONS_00065193 lncRNA downstream 1221871 36386292 ~ 36393495 (-) True XLOC_032984
TCONS_00065192 lncRNA downstream 1325492 36287886 ~ 36289874 (-) True XLOC_032983
TCONS_00064129 lncRNA upstream 133072 37748555 ~ 37749697 (-) True XLOC_033005
TCONS_00065196 lncRNA upstream 517028 38132511 ~ 38358080 (-) False XLOC_033006
TCONS_00065197 lncRNA upstream 1144063 38759546 ~ 38763847 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065198 lncRNA upstream 1144063 38759546 ~ 38764324 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065199 lncRNA upstream 1144063 38759546 ~ 38764326 (-) False XLOC_033009
TCONS_00064121 mRNA downstream 89487 37514599 ~ 37525879 (-) True XLOC_033001
TCONS_00064120 mRNA downstream 89683 37513911 ~ 37525683 (-) False XLOC_033001
TCONS_00064117 mRNA downstream 102233 37478765 ~ 37513133 (-) False XLOC_033000
TCONS_00064118 mRNA downstream 115792 37479283 ~ 37499574 (-) False XLOC_033000
TCONS_00064115 mRNA downstream 145591 37460269 ~ 37469775 (-) False XLOC_032999
TCONS_00064124 mRNA upstream 118125 37733608 ~ 37745508 (-) False XLOC_033004
TCONS_00064125 mRNA upstream 118834 37734317 ~ 37744441 (-) False XLOC_033004
TCONS_00064126 mRNA upstream 118843 37734326 ~ 37743724 (-) False XLOC_033004
TCONS_00064127 mRNA upstream 118967 37734450 ~ 37744430 (-) True XLOC_033004
TCONS_00064128 mRNA upstream 130236 37745719 ~ 37749711 (-) False XLOC_033005
TCONS_00064119 other downstream 116510 37498146 ~ 37498856 (-) True XLOC_033000
TCONS_00064112 other downstream 168223 37447028 ~ 37447143 (-) True XLOC_032997
TCONS_00064111 other downstream 175996 37439255 ~ 37439370 (-) True XLOC_032996
TCONS_00064106 other downstream 845297 36769939 ~ 36770069 (-) True XLOC_032991
TCONS_00064105 other downstream 871115 36744134 ~ 36744251 (-) True XLOC_032990
TCONS_00064130 other upstream 517028 38132511 ~ 38357713 (-) False XLOC_033006
TCONS_00064131 other upstream 740279 38355762 ~ 38358080 (-) True XLOC_033006
TCONS_00064134 other upstream 751613 38367096 ~ 38426942 (-) True XLOC_033007
TCONS_00064135 other upstream 982186 38597669 ~ 38597784 (-) True XLOC_033008
TCONS_00064151 other upstream 1449342 39064825 ~ 39068492 (-) False XLOC_033015

Expression Profile

//