RNA id: TCONS_00064391


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064391
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_033135
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 47156302 ~ 47156416 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atttacagccatatcacccagcaGCAAGacaggttactcactgaagctgagcagggctgagcttggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184543

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064380 lncRNA downstream 584873 46568134 ~ 46571429 (-) True XLOC_033127
TCONS_00064373 lncRNA downstream 846291 46294361 ~ 46310011 (-) True XLOC_033123
TCONS_00064370 lncRNA downstream 993717 46102214 ~ 46162585 (-) True XLOC_033120
TCONS_00065222 lncRNA downstream 1227127 45923942 ~ 45929175 (-) True XLOC_033118
TCONS_00064365 lncRNA downstream 1277162 45875242 ~ 45879140 (-) True XLOC_033117
TCONS_00064398 lncRNA upstream 678937 47835353 ~ 47838372 (-) True XLOC_033139
TCONS_00065223 lncRNA upstream 822889 47979305 ~ 48051590 (-) False XLOC_033141
TCONS_00064401 lncRNA upstream 822889 47979305 ~ 48061524 (-) False XLOC_033141
TCONS_00064756 lncRNA upstream 889870 48046286 ~ 48061659 (-) True XLOC_033141
TCONS_00065224 lncRNA upstream 1758452 48914868 ~ 48949493 (-) False XLOC_033149
TCONS_00064389 mRNA downstream 215057 46878889 ~ 46941245 (-) True XLOC_033133
TCONS_00064388 mRNA downstream 280992 46843733 ~ 46875310 (-) True XLOC_033132
TCONS_00064387 mRNA downstream 294626 46843592 ~ 46861676 (-) False XLOC_033132
TCONS_00064386 mRNA downstream 294626 46843592 ~ 46861676 (-) False XLOC_033132
TCONS_00064385 mRNA downstream 366260 46771853 ~ 46790042 (-) True XLOC_033131
TCONS_00064392 mRNA upstream 327668 47484084 ~ 47506351 (-) True XLOC_033136
TCONS_00064393 mRNA upstream 373465 47529881 ~ 47796989 (-) False XLOC_033137
TCONS_00064394 mRNA upstream 414855 47571271 ~ 47632398 (-) True XLOC_033137
TCONS_00064396 mRNA upstream 653339 47809755 ~ 47840465 (-) False XLOC_033139
TCONS_00064397 mRNA upstream 657471 47813887 ~ 47838481 (-) False XLOC_033139
TCONS_00064371 other downstream 904362 46168017 ~ 46251940 (-) True XLOC_033121
TCONS_00064372 other downstream 928070 46228117 ~ 46228232 (-) True XLOC_033122
TCONS_00064360 other downstream 2876088 44254721 ~ 44280214 (-) True XLOC_033114
TCONS_00064349 other downstream 3265840 43790137 ~ 43890462 (-) False XLOC_033109
TCONS_00064395 other upstream 446183 47602599 ~ 47602715 (-) True XLOC_033138
TCONS_00064408 other upstream 1223829 48380245 ~ 48381223 (-) True XLOC_033145
TCONS_00064412 other upstream 1455618 48612034 ~ 48612150 (-) True XLOC_033148
TCONS_00064417 other upstream 1959603 49116019 ~ 49159094 (-) True XLOC_033153
TCONS_00064440 other upstream 2737072 49893488 ~ 49902140 (-) True XLOC_033166