RNA id: TCONS_00006434



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006434
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_003262
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 11429393 ~ 11429689 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaagctgctgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTTGATCGGGTGTCCGCGCTAAGTTCGGTATCGATATGGTTCTCCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGACGGAGACGGAGCAGGTCAAAGCACCCATGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCATCCTGAGcaacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000192383

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006420 lncRNA upstream 48506 11353459 ~ 11380887 (+) True XLOC_003252
TCONS_00008391 lncRNA upstream 69678 11359421 ~ 11359715 (+) True XLOC_003253
TCONS_00006410 lncRNA upstream 157079 11267906 ~ 11272314 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006406 lncRNA upstream 188449 11239448 ~ 11240944 (+) True XLOC_003247
TCONS_00008390 lncRNA upstream 363601 11065500 ~ 11065792 (+) True XLOC_003244
TCONS_00006441 lncRNA downstream 74325 11504014 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006446 lncRNA downstream 74678 11504367 ~ 11513412 (+) True XLOC_003268
TCONS_00006447 lncRNA downstream 158389 11588078 ~ 11590676 (+) True XLOC_003269
TCONS_00006451 lncRNA downstream 347678 11777367 ~ 11780863 (+) True XLOC_003270
TCONS_00006452 lncRNA downstream 362719 11792408 ~ 11796299 (+) True XLOC_003271
TCONS_00006432 mRNA upstream 8287 11419186 ~ 11421106 (+) False XLOC_003261
TCONS_00006433 mRNA upstream 9068 11419359 ~ 11420325 (+) True XLOC_003261
TCONS_00006429 mRNA upstream 19649 11407892 ~ 11409744 (+) False XLOC_003259
TCONS_00006430 mRNA upstream 20430 11407994 ~ 11408963 (+) True XLOC_003259
TCONS_00006427 mRNA upstream 39931 11387509 ~ 11389462 (+) False XLOC_003258
TCONS_00006435 mRNA downstream 863 11430552 ~ 11432479 (+) False XLOC_003263
TCONS_00006436 mRNA downstream 1036 11430725 ~ 11431699 (+) True XLOC_003263
TCONS_00006442 mRNA downstream 74325 11504014 ~ 11513979 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006443 mRNA downstream 74325 11504014 ~ 11513985 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006444 mRNA downstream 74374 11504063 ~ 11513985 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006431 other upstream 11070 11418033 ~ 11418323 (+) True XLOC_003260
TCONS_00006426 other upstream 42735 11386362 ~ 11386658 (+) True XLOC_003257
TCONS_00006423 other upstream 56211 11372886 ~ 11373182 (+) True XLOC_003255
TCONS_00006417 other upstream 83294 11345803 ~ 11346099 (+) True XLOC_003250
TCONS_00006412 other upstream 154793 11271934 ~ 11274600 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006437 other downstream 11771 11441460 ~ 11441756 (+) True XLOC_003264
TCONS_00006438 other downstream 20466 11450155 ~ 11450442 (+) True XLOC_003265
TCONS_00006439 other downstream 31117 11460806 ~ 11461102 (+) True XLOC_003266
TCONS_00006440 other downstream 32617 11462306 ~ 11462602 (+) True XLOC_003267
TCONS_00006445 other downstream 74572 11504261 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268

Expression Profile


//