RNA id: TCONS_00064432


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064432
length 174
RNA type mRNA
GC content 0.51
exon number 3
gene id XLOC_033161
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 49628431 ~ 49634787 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atgtccttccagctgcaacccaCGGGCATGTCAAAGACACATCTCAGCTTGGAGTCCATCAGATCTTCAGGCTTGGCATCAGCACTCACCACTCCCTCAGTGTCGGTCATGTCAGGCGGAGCCAGCAGAGACTGTACCATAAACTTGTGTTTGCTTTTCTCATTCGGGTCATAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000188538

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065230 lncRNA downstream 305899 49320009 ~ 49322532 (-) True XLOC_033155
TCONS_00065229 lncRNA downstream 305907 49320009 ~ 49322524 (-) False XLOC_033155
TCONS_00064426 lncRNA downstream 305918 49320009 ~ 49322513 (-) False XLOC_033155
TCONS_00065228 lncRNA downstream 305941 49320009 ~ 49322490 (-) False XLOC_033155
TCONS_00065227 lncRNA downstream 305946 49320009 ~ 49322485 (-) False XLOC_033155
TCONS_00065231 lncRNA upstream 125568 49760355 ~ 49762940 (-) False XLOC_033163
TCONS_00065232 lncRNA upstream 128879 49763666 ~ 49771639 (-) True XLOC_033163
TCONS_00064441 lncRNA upstream 283467 49918254 ~ 49926317 (-) True XLOC_033167
TCONS_00064442 lncRNA upstream 285149 49919936 ~ 49921857 (-) True XLOC_033168
TCONS_00065233 lncRNA upstream 724870 50359657 ~ 50380212 (-) True XLOC_033172
TCONS_00064430 mRNA downstream 80751 49541278 ~ 49547680 (-) True XLOC_033159
TCONS_00064429 mRNA downstream 90785 49529014 ~ 49537646 (-) True XLOC_033158
TCONS_00064428 mRNA downstream 101921 49520124 ~ 49526510 (-) True XLOC_033157
TCONS_00064427 mRNA downstream 117878 49508805 ~ 49510553 (-) True XLOC_033156
TCONS_00064424 mRNA downstream 458041 49169803 ~ 49170390 (-) True XLOC_033154
TCONS_00064433 mRNA upstream 15383 49650170 ~ 49655879 (-) False XLOC_033162
TCONS_00064434 mRNA upstream 16089 49650876 ~ 49673476 (-) True XLOC_033162
TCONS_00064435 mRNA upstream 126442 49761229 ~ 49769100 (-) False XLOC_033163
TCONS_00064436 mRNA upstream 147097 49781884 ~ 49801173 (-) True XLOC_033164
TCONS_00064437 mRNA upstream 177044 49811831 ~ 49861506 (-) False XLOC_033165
TCONS_00064417 other downstream 469337 49116019 ~ 49159094 (-) True XLOC_033153
TCONS_00064412 other downstream 1016281 48612034 ~ 48612150 (-) True XLOC_033148
TCONS_00064408 other downstream 1247208 48380245 ~ 48381223 (-) True XLOC_033145
TCONS_00064395 other downstream 2025716 47602599 ~ 47602715 (-) True XLOC_033138
TCONS_00064391 other downstream 2472015 47156302 ~ 47156416 (-) True XLOC_033135
TCONS_00064440 other upstream 258701 49893488 ~ 49902140 (-) True XLOC_033166
TCONS_00064447 other upstream 500532 50135319 ~ 50135437 (-) True XLOC_033171
TCONS_00064450 other upstream 950715 50585502 ~ 50587730 (-) True XLOC_033175
TCONS_00064454 other upstream 1107528 50742315 ~ 50744929 (-) False XLOC_033178
TCONS_00064455 other upstream 1109373 50744160 ~ 50745255 (-) False XLOC_033178