RNA id: TCONS_00064553



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00064553
length 136
RNA type rRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_033251
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 57263510 ~ 57263645 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCTATGGTCATACTACAGTTTGTGTGTATGAAATTCTGTCATAccgcgctgcgaaaaggggtgggaataaacaagatgattagacattagtacctggatgggagaccactagggaacactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000158337

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064765 lncRNA downstream 140600 57108325 ~ 57122910 (-) True XLOC_033250
TCONS_00065257 lncRNA downstream 155322 56954940 ~ 57108188 (-) True XLOC_033249
TCONS_00064764 lncRNA downstream 644953 56508611 ~ 56618557 (-) True XLOC_033245
TCONS_00065255 lncRNA downstream 695598 56330271 ~ 56567912 (-) False XLOC_033245
TCONS_00064763 lncRNA downstream 720744 56508611 ~ 56542766 (-) False XLOC_033245
TCONS_00065258 lncRNA upstream 357260 57620905 ~ 57621869 (-) True XLOC_033256
TCONS_00064560 lncRNA upstream 366769 57630414 ~ 57631164 (-) True XLOC_033257
TCONS_00065259 lncRNA upstream 433490 57697135 ~ 57722862 (-) True XLOC_033258
TCONS_00065260 lncRNA upstream 524075 57787720 ~ 57790025 (-) True XLOC_033260
TCONS_00065261 lncRNA upstream 817990 58081635 ~ 58082635 (-) True XLOC_033262
TCONS_00064552 mRNA downstream 386144 56638688 ~ 56877366 (-) True XLOC_033248
TCONS_00064549 mRNA downstream 1151681 56097971 ~ 56111829 (-) False XLOC_033244
TCONS_00064550 mRNA downstream 1159792 56100756 ~ 56103718 (-) True XLOC_033244
TCONS_00064547 mRNA downstream 1266160 55909795 ~ 55997350 (-) False XLOC_033241
TCONS_00064548 mRNA downstream 1304805 55946161 ~ 55958705 (-) True XLOC_033241
TCONS_00064554 mRNA upstream 137533 57401178 ~ 57408576 (-) False XLOC_033252
TCONS_00064555 mRNA upstream 138728 57402373 ~ 57426097 (-) True XLOC_033252
TCONS_00064556 mRNA upstream 172669 57436314 ~ 57476465 (-) True XLOC_033253
TCONS_00064557 mRNA upstream 214692 57478337 ~ 57485411 (-) True XLOC_033254
TCONS_00064558 mRNA upstream 228149 57491794 ~ 57539141 (-) False XLOC_033255
TCONS_00064551 other downstream 724385 56539009 ~ 56539125 (-) True XLOC_033247
TCONS_00064544 other downstream 1613259 55650119 ~ 55650251 (-) True XLOC_033238
TCONS_00064543 other downstream 1708114 55555262 ~ 55555396 (-) True XLOC_033237
TCONS_00064542 other downstream 1716240 55547135 ~ 55547270 (-) True XLOC_033236
TCONS_00064531 other downstream 2448473 54814921 ~ 54815037 (-) True XLOC_033225
TCONS_00064559 other upstream 250189 57513834 ~ 57519523 (-) True XLOC_033255
TCONS_00064565 other upstream 505897 57769542 ~ 57769658 (-) True XLOC_033259
TCONS_00064577 other upstream 1873026 59136671 ~ 59136787 (-) True XLOC_033272
TCONS_00064585 other upstream 2421500 59685145 ~ 59685261 (-) True XLOC_033280