RNA id: TCONS_00064577



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00064577
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_033272
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 59136671 ~ 59136787 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gaccACAGTCTGatcaccctgcagctcaagaGCAGTCCCTCACTGAAGATGAGCAGGGCTGAGGCTGGTCAGTGTctggatgggagagcacatgggaacactaggctgctgttggag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000167227

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065268 lncRNA downstream 67768 59066955 ~ 59068903 (-) True XLOC_033271
TCONS_00065266 lncRNA downstream 83466 59050986 ~ 59053205 (-) False XLOC_033270
TCONS_00065267 lncRNA downstream 84032 59051400 ~ 59052639 (-) True XLOC_033270
TCONS_00065265 lncRNA downstream 84321 59050986 ~ 59052350 (-) False XLOC_033270
TCONS_00065264 lncRNA downstream 85843 59047907 ~ 59050828 (-) True XLOC_033269
TCONS_00065269 lncRNA upstream 31273 59168060 ~ 59171539 (-) True XLOC_033273
TCONS_00065270 lncRNA upstream 259060 59395847 ~ 59409082 (-) False XLOC_033277
TCONS_00064766 lncRNA upstream 272211 59408998 ~ 59421470 (-) True XLOC_033277
TCONS_00065271 lncRNA upstream 698843 59835630 ~ 59853683 (-) True XLOC_033281
TCONS_00065272 lncRNA upstream 836915 59973702 ~ 59974697 (-) False XLOC_033283
TCONS_00064576 mRNA downstream 161652 58921240 ~ 58975019 (-) True XLOC_033268
TCONS_00064575 mRNA downstream 161661 58921240 ~ 58975010 (-) False XLOC_033268
TCONS_00064573 mRNA downstream 226269 58871600 ~ 58910402 (-) False XLOC_033267
TCONS_00064574 mRNA downstream 235119 58871966 ~ 58901552 (-) True XLOC_033267
TCONS_00064571 mRNA downstream 308273 58772209 ~ 58828398 (-) False XLOC_033266
TCONS_00064578 mRNA upstream 118349 59255136 ~ 59271436 (-) False XLOC_033274
TCONS_00064579 mRNA upstream 126345 59263132 ~ 59271270 (-) True XLOC_033274
TCONS_00064580 mRNA upstream 213670 59350457 ~ 59357256 (-) True XLOC_033275
TCONS_00064581 mRNA upstream 234034 59370821 ~ 59381391 (-) False XLOC_033276
TCONS_00064582 mRNA upstream 236025 59372812 ~ 59388625 (-) True XLOC_033276
TCONS_00064565 other downstream 1367013 57769542 ~ 57769658 (-) True XLOC_033259
TCONS_00064559 other downstream 1617148 57513834 ~ 57519523 (-) True XLOC_033255
TCONS_00064553 other downstream 1873026 57263510 ~ 57263645 (-) True XLOC_033251
TCONS_00064551 other downstream 2597546 56539009 ~ 56539125 (-) True XLOC_033247
TCONS_00064544 other downstream 3486420 55650119 ~ 55650251 (-) True XLOC_033238
TCONS_00064585 other upstream 548358 59685145 ~ 59685261 (-) True XLOC_033280