RNA id: TCONS_00064585


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064585
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.61
exon number 1
gene id XLOC_033280
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 59685145 ~ 59685261 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGCCGCAGTCagatcaccctgcagcccaagactggtccCGCACTGAAGATGAGCAGGGCTGAGGCTGGTCAGTGTctggatgggagagcacatgggaacactaggctgctgttggca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000163333

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064766 lncRNA downstream 263675 59408998 ~ 59421470 (-) True XLOC_033277
TCONS_00065270 lncRNA downstream 276063 59395847 ~ 59409082 (-) False XLOC_033277
TCONS_00065269 lncRNA downstream 513606 59168060 ~ 59171539 (-) True XLOC_033273
TCONS_00065268 lncRNA downstream 616242 59066955 ~ 59068903 (-) True XLOC_033271
TCONS_00065266 lncRNA downstream 631940 59050986 ~ 59053205 (-) False XLOC_033270
TCONS_00065271 lncRNA upstream 150369 59835630 ~ 59853683 (-) True XLOC_033281
TCONS_00065272 lncRNA upstream 288441 59973702 ~ 59974697 (-) False XLOC_033283
TCONS_00065273 lncRNA upstream 288441 59973702 ~ 59974747 (-) True XLOC_033283
TCONS_00065274 lncRNA upstream 582546 60267807 ~ 60269211 (-) True XLOC_033289
TCONS_00064584 mRNA downstream 121548 59557501 ~ 59563597 (-) True XLOC_033279
TCONS_00064583 mRNA downstream 179556 59426148 ~ 59505589 (-) True XLOC_033278
TCONS_00064582 mRNA downstream 296520 59372812 ~ 59388625 (-) True XLOC_033276
TCONS_00064581 mRNA downstream 303754 59370821 ~ 59381391 (-) False XLOC_033276
TCONS_00064580 mRNA downstream 327889 59350457 ~ 59357256 (-) True XLOC_033275
TCONS_00064586 mRNA upstream 250689 59935950 ~ 59942335 (-) True XLOC_033282
TCONS_00064589 mRNA upstream 332972 60018233 ~ 60020385 (-) False XLOC_033284
TCONS_00064588 mRNA upstream 332972 60018233 ~ 60020385 (-) False XLOC_033284
TCONS_00064587 mRNA upstream 332972 60018233 ~ 60020385 (-) True XLOC_033284
TCONS_00064590 mRNA upstream 338856 60024117 ~ 60031693 (-) True XLOC_033285
TCONS_00064577 other downstream 548358 59136671 ~ 59136787 (-) True XLOC_033272
TCONS_00064565 other downstream 1915487 57769542 ~ 57769658 (-) True XLOC_033259
TCONS_00064559 other downstream 2165622 57513834 ~ 57519523 (-) True XLOC_033255
TCONS_00064553 other downstream 2421500 57263510 ~ 57263645 (-) True XLOC_033251
TCONS_00064551 other downstream 3146020 56539009 ~ 56539125 (-) True XLOC_033247

Expression Profile

//