RNA id: TCONS_00006465



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006465
length 301
RNA type misc_RNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_003288
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12215328 ~ 12215628 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccggtgtttgacacagaagtataaatcaaccttaagctactgggaggctgaggctgcggatcacttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTATGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGAGGAGCTTGGGACCACCAGGTCGTTTAAAGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCAGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGAGAATAGACATTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000130025

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 48538 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 311818 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 251138 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 278244 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 307142 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 502481 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 529007 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 30785 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 31068 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 123150 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 235474 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 365333 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 504316 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 504360 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 504543 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 504680 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 528947 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006464 other upstream 6123 12208909 ~ 12209205 (+) True XLOC_003287
TCONS_00006463 other upstream 25304 12189725 ~ 12190024 (+) True XLOC_003286
TCONS_00006462 other upstream 27726 12187306 ~ 12187602 (+) True XLOC_003285
TCONS_00006459 other upstream 43737 12171295 ~ 12171591 (+) True XLOC_003283
TCONS_00006457 other upstream 52280 12162752 ~ 12163048 (+) True XLOC_003281
TCONS_00006466 other downstream 7834 12223462 ~ 12223758 (+) True XLOC_003289
TCONS_00006467 other downstream 32060 12247688 ~ 12247984 (+) True XLOC_003290
TCONS_00006468 other downstream 40803 12256431 ~ 12256727 (+) True XLOC_003291
TCONS_00006469 other downstream 76317 12291945 ~ 12292241 (+) True XLOC_003292
TCONS_00006470 other downstream 101986 12317614 ~ 12317910 (+) True XLOC_003293

Expression Profile


//