RNA id: TCONS_00006470



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006470
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_003293
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12317614 ~ 12317910 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTTCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGCGGATCGCTTGAGCTCAGGGTTTCTGGACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTATCCGCACTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGTGAGCTTGGGACCGCCAGGTCGTTTAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTTGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGTGCCTGTGAATAGACACTTCAGTTCAACCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189544

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 150824 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 414104 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 148856 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 175962 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 204860 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 400199 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 426725 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 133071 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 133354 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 225436 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 337760 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 467619 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 402034 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 402078 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 402261 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 402398 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 426665 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006469 other upstream 25373 12291945 ~ 12292241 (+) True XLOC_003292
TCONS_00006468 other upstream 60887 12256431 ~ 12256727 (+) True XLOC_003291
TCONS_00006467 other upstream 69630 12247688 ~ 12247984 (+) True XLOC_003290
TCONS_00006466 other upstream 93856 12223462 ~ 12223758 (+) True XLOC_003289
TCONS_00006465 other upstream 101986 12215328 ~ 12215628 (+) True XLOC_003288
TCONS_00006471 other downstream 8296 12326206 ~ 12326502 (+) True XLOC_003294
TCONS_00006472 other downstream 27182 12345092 ~ 12345388 (+) True XLOC_003295
TCONS_00006473 other downstream 35924 12353834 ~ 12354130 (+) True XLOC_003296
TCONS_00006474 other downstream 55756 12373666 ~ 12373962 (+) True XLOC_003297
TCONS_00006475 other downstream 70637 12388547 ~ 12388847 (+) True XLOC_003298