RNA id: TCONS_00006472



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006472
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_003295
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12345092 ~ 12345388 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTTCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGCTACAGGTTGGCTGAGGCTGCGGatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGTGAGCTCGGGACCGCCAGGTTGTTTAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGTGCCAGTGAATAGACACTTCAGTTCAGTCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183420

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 178302 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 441582 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 121378 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 148484 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 177382 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 372721 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 399247 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 160549 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 160832 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 252914 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 365238 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 495097 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 374556 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 374600 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 374783 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 374920 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 399187 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006471 other upstream 18590 12326206 ~ 12326502 (+) True XLOC_003294
TCONS_00006470 other upstream 27182 12317614 ~ 12317910 (+) True XLOC_003293
TCONS_00006469 other upstream 52851 12291945 ~ 12292241 (+) True XLOC_003292
TCONS_00006468 other upstream 88365 12256431 ~ 12256727 (+) True XLOC_003291
TCONS_00006467 other upstream 97108 12247688 ~ 12247984 (+) True XLOC_003290
TCONS_00006473 other downstream 8446 12353834 ~ 12354130 (+) True XLOC_003296
TCONS_00006474 other downstream 28278 12373666 ~ 12373962 (+) True XLOC_003297
TCONS_00006475 other downstream 43159 12388547 ~ 12388847 (+) True XLOC_003298
TCONS_00006476 other downstream 60342 12405730 ~ 12406015 (+) True XLOC_003299
TCONS_00006477 other downstream 86590 12431978 ~ 12432265 (+) True XLOC_003300

Expression Profile


//