RNA id: TCONS_00006478



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006478
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_003301
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12440656 ~ 12440952 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTTCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGCGGatcgcttgagctcagggcttctggGCTGCAGTGGACTATGTTGATCGGGTGTCCGCGTTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCTAATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183658

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 273866 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 537146 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 25814 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 52920 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 81818 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 277157 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 303683 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 256113 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 256396 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 348478 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 460802 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 590661 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 278992 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 279036 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 279219 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 279356 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 303623 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006477 other upstream 8391 12431978 ~ 12432265 (+) True XLOC_003300
TCONS_00006476 other upstream 34641 12405730 ~ 12406015 (+) True XLOC_003299
TCONS_00006475 other upstream 51809 12388547 ~ 12388847 (+) True XLOC_003298
TCONS_00006474 other upstream 66694 12373666 ~ 12373962 (+) True XLOC_003297
TCONS_00006473 other upstream 86526 12353834 ~ 12354130 (+) True XLOC_003296
TCONS_00006479 other downstream 34490 12475442 ~ 12475702 (+) True XLOC_003303
TCONS_00006481 other downstream 61599 12502551 ~ 12502847 (+) True XLOC_003305
TCONS_00006482 other downstream 75981 12516933 ~ 12517229 (+) True XLOC_003306
TCONS_00006483 other downstream 95332 12536284 ~ 12536580 (+) True XLOC_003308
TCONS_00006484 other downstream 101087 12542039 ~ 12542334 (+) True XLOC_003309

Expression Profile


//