RNA id: TCONS_00006481



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006481
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_003305
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12502551 ~ 12502847 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaagctacagggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggGCTGCAGTGGACTATGTTGATCGGGTGTCCGCGTTAAGTTCGGTATCGATATGGTTCTTCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180501

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006480 lncRNA upstream 8374 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 35491 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 335761 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008569 lncRNA upstream 599041 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008394 lncRNA downstream 19923 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 215262 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 241788 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 279368 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 376880 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 318008 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 318291 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 410373 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 522697 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 652556 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 217097 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 217141 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 217324 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 217461 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 241728 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006479 other upstream 26849 12475442 ~ 12475702 (+) True XLOC_003303
TCONS_00006478 other upstream 61599 12440656 ~ 12440952 (+) True XLOC_003301
TCONS_00006477 other upstream 70286 12431978 ~ 12432265 (+) True XLOC_003300
TCONS_00006476 other upstream 96536 12405730 ~ 12406015 (+) True XLOC_003299
TCONS_00006475 other upstream 113704 12388547 ~ 12388847 (+) True XLOC_003298
TCONS_00006482 other downstream 14086 12516933 ~ 12517229 (+) True XLOC_003306
TCONS_00006483 other downstream 33437 12536284 ~ 12536580 (+) True XLOC_003308
TCONS_00006484 other downstream 39192 12542039 ~ 12542334 (+) True XLOC_003309
TCONS_00006485 other downstream 65140 12567987 ~ 12568283 (+) True XLOC_003310
TCONS_00006486 other downstream 75685 12578532 ~ 12578828 (+) True XLOC_003311

Expression Profile


//