RNA id: TCONS_00006484



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006484
length 296
RNA type misc_RNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_003309
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12542039 ~ 12542334 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccagggccgaatttttgtcccagtccgcccctgactgGGAGGCTGAGGCTGCGGATCGCTTGAGCTCAAGGCTTCTGGACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGCCCACACTAAGTTCGGTATCAATATGGTGCACCTGGGTGAGCTTGGGACCGCCAGGTCGTTAAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGTGCCTGTGAATAGACACTTCAGTTCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000122842

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008394 lncRNA upstream 19010 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006480 lncRNA upstream 47862 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 74979 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 375249 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008573 lncRNA upstream 638529 11896541 ~ 11903510 (+) True XLOC_003278
TCONS_00006494 lncRNA downstream 175775 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 202301 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 239881 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 337393 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00008396 lncRNA downstream 346957 12889291 ~ 12889880 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 357496 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 357779 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 449861 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 562185 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 692044 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 177610 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 177654 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 177837 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 177974 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 202241 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006483 other upstream 5459 12536284 ~ 12536580 (+) True XLOC_003308
TCONS_00006482 other upstream 24810 12516933 ~ 12517229 (+) True XLOC_003306
TCONS_00006481 other upstream 39192 12502551 ~ 12502847 (+) True XLOC_003305
TCONS_00006479 other upstream 66337 12475442 ~ 12475702 (+) True XLOC_003303
TCONS_00006478 other upstream 101087 12440656 ~ 12440952 (+) True XLOC_003301
TCONS_00006485 other downstream 25653 12567987 ~ 12568283 (+) True XLOC_003310
TCONS_00006486 other downstream 36198 12578532 ~ 12578828 (+) True XLOC_003311
TCONS_00006487 other downstream 51237 12593571 ~ 12593867 (+) True XLOC_003312
TCONS_00006488 other downstream 64742 12607076 ~ 12607370 (+) True XLOC_003313
TCONS_00006489 other downstream 81221 12623555 ~ 12623851 (+) True XLOC_003314