RNA id: TCONS_00006488



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006488
length 295
RNA type misc_RNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_003313
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12607076 ~ 12607370 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaatactgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCACCTGGGTGAGCTTGGGACTGTCAGGTCGTTTAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGTGCCTGTGAATAGACACTTCAGTTCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000171226

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008394 lncRNA upstream 84047 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006480 lncRNA upstream 112899 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 140016 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 440286 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008573 lncRNA upstream 703566 11896541 ~ 11903510 (+) True XLOC_003278
TCONS_00006494 lncRNA downstream 110739 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 137265 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 174845 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 272357 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00008396 lncRNA downstream 281921 12889291 ~ 12889880 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 422533 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 422816 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 514898 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 627222 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 757081 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 112574 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 112618 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 112801 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 112938 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 137205 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006487 other upstream 13209 12593571 ~ 12593867 (+) True XLOC_003312
TCONS_00006486 other upstream 28248 12578532 ~ 12578828 (+) True XLOC_003311
TCONS_00006485 other upstream 38793 12567987 ~ 12568283 (+) True XLOC_003310
TCONS_00006484 other upstream 64742 12542039 ~ 12542334 (+) True XLOC_003309
TCONS_00006483 other upstream 70496 12536284 ~ 12536580 (+) True XLOC_003308
TCONS_00006489 other downstream 16185 12623555 ~ 12623851 (+) True XLOC_003314
TCONS_00006490 other downstream 72362 12679732 ~ 12680028 (+) True XLOC_003315
TCONS_00006491 other downstream 77934 12685304 ~ 12685599 (+) True XLOC_003316
TCONS_00006492 other downstream 86597 12693967 ~ 12694263 (+) True XLOC_003317
TCONS_00006493 other downstream 104330 12711700 ~ 12711996 (+) True XLOC_003318

Expression Profile


//