RNA id: TCONS_00006490



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006490
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_003315
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12679732 ~ 12680028 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaagctactgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggGCTGCAGTGGACTATGTTGATCGGGTGTCCGCGTTAAGTTCGGTATCGGTATGGTTCTCCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTACGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTTAGAGACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTAAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184123

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008394 lncRNA upstream 156703 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006480 lncRNA upstream 185555 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 212672 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 512942 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008573 lncRNA upstream 776222 11896541 ~ 11903510 (+) True XLOC_003278
TCONS_00006494 lncRNA downstream 38081 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 64607 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 102187 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 199699 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00008396 lncRNA downstream 209263 12889291 ~ 12889880 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 495189 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 495472 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 587554 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 699878 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 829737 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 39916 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 39960 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 40143 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 40280 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 64547 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006489 other upstream 55881 12623555 ~ 12623851 (+) True XLOC_003314
TCONS_00006488 other upstream 72362 12607076 ~ 12607370 (+) True XLOC_003313
TCONS_00006487 other upstream 85865 12593571 ~ 12593867 (+) True XLOC_003312
TCONS_00006486 other upstream 100904 12578532 ~ 12578828 (+) True XLOC_003311
TCONS_00006485 other upstream 111449 12567987 ~ 12568283 (+) True XLOC_003310
TCONS_00006491 other downstream 5276 12685304 ~ 12685599 (+) True XLOC_003316
TCONS_00006492 other downstream 13939 12693967 ~ 12694263 (+) True XLOC_003317
TCONS_00006493 other downstream 31672 12711700 ~ 12711996 (+) True XLOC_003318
TCONS_00006509 other downstream 250129 12930157 ~ 12946210 (+) True XLOC_003325
TCONS_00006540 other downstream 1137541 13817569 ~ 13817684 (+) True XLOC_003341

Expression Profile


//