RNA id: TCONS_00006491



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006491
length 296
RNA type misc_RNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_003316
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12685304 ~ 12685599 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccagggccgaatttttgtcccagtccgcccctgactgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGTGAGCTCGGGACCGCCAGGTCGTTAAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTTCAGTTCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000123685

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008394 lncRNA upstream 162275 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006480 lncRNA upstream 191127 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 218244 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 518514 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008573 lncRNA upstream 781794 11896541 ~ 11903510 (+) True XLOC_003278
TCONS_00006494 lncRNA downstream 32510 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 59036 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 96616 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 194128 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00008396 lncRNA downstream 203692 12889291 ~ 12889880 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 500761 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 501044 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 593126 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 705450 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 835309 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 34345 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 34389 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 34572 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 34709 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 58976 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006490 other upstream 5276 12679732 ~ 12680028 (+) True XLOC_003315
TCONS_00006489 other upstream 61453 12623555 ~ 12623851 (+) True XLOC_003314
TCONS_00006488 other upstream 77934 12607076 ~ 12607370 (+) True XLOC_003313
TCONS_00006487 other upstream 91437 12593571 ~ 12593867 (+) True XLOC_003312
TCONS_00006486 other upstream 106476 12578532 ~ 12578828 (+) True XLOC_003311
TCONS_00006492 other downstream 8368 12693967 ~ 12694263 (+) True XLOC_003317
TCONS_00006493 other downstream 26101 12711700 ~ 12711996 (+) True XLOC_003318
TCONS_00006509 other downstream 244558 12930157 ~ 12946210 (+) True XLOC_003325
TCONS_00006540 other downstream 1131970 13817569 ~ 13817684 (+) True XLOC_003341
TCONS_00006541 other downstream 1179247 13864846 ~ 13864964 (+) True XLOC_003342

Expression Profile


//