RNA id: TCONS_00006492



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006492
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_003317
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12693967 ~ 12694263 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaagctactgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggGCTGCAGTGGACTATGTTGATCGGGTGTCCGCGTTAAGTTCGGTATCGATATGGTTCTCCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191304

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008394 lncRNA upstream 170938 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006480 lncRNA upstream 199790 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008393 lncRNA upstream 226907 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006458 lncRNA upstream 527177 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008573 lncRNA upstream 790457 11896541 ~ 11903510 (+) True XLOC_003278
TCONS_00006494 lncRNA downstream 23846 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 50372 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00008574 lncRNA downstream 87952 12782215 ~ 12785059 (+) True XLOC_003322
TCONS_00008395 lncRNA downstream 185464 12879727 ~ 12880871 (+) False XLOC_003325
TCONS_00008396 lncRNA downstream 195028 12889291 ~ 12889880 (+) False XLOC_003325
TCONS_00006460 mRNA upstream 509424 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 509707 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 601789 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 714113 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 843972 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 25681 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 25725 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 25908 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 26045 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 50312 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006491 other upstream 8368 12685304 ~ 12685599 (+) True XLOC_003316
TCONS_00006490 other upstream 13939 12679732 ~ 12680028 (+) True XLOC_003315
TCONS_00006489 other upstream 70116 12623555 ~ 12623851 (+) True XLOC_003314
TCONS_00006488 other upstream 86597 12607076 ~ 12607370 (+) True XLOC_003313
TCONS_00006487 other upstream 100100 12593571 ~ 12593867 (+) True XLOC_003312
TCONS_00006493 other downstream 17437 12711700 ~ 12711996 (+) True XLOC_003318
TCONS_00006509 other downstream 235894 12930157 ~ 12946210 (+) True XLOC_003325
TCONS_00006540 other downstream 1123306 13817569 ~ 13817684 (+) True XLOC_003341
TCONS_00006541 other downstream 1170583 13864846 ~ 13864964 (+) True XLOC_003342
TCONS_00006553 other downstream 1505633 14199896 ~ 14248440 (+) True XLOC_003347

Expression Profile


//