RNA id: TCONS_00006668



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006668
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_003402
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 20033066 ~ 20033185 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCAATTGTatacagctagctctctgcatctcccacatggtcgcccactgaagctaagcatggCTTCGCCCGGTCAGTCCTTGGAtgtgagaccacatgggaaagcttggttgcattagtg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120847

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006647 lncRNA upstream 1199820 18832913 ~ 18833246 (+) True XLOC_003395
TCONS_00008585 lncRNA upstream 1290963 18741027 ~ 18742103 (+) True XLOC_003394
TCONS_00006646 lncRNA upstream 1325007 18702362 ~ 18708059 (+) False XLOC_003393
TCONS_00008584 lncRNA upstream 1325007 18704129 ~ 18708059 (+) True XLOC_003393
TCONS_00008583 lncRNA upstream 2072976 17957279 ~ 17960090 (+) True XLOC_003381
TCONS_00008586 lncRNA downstream 854925 20888110 ~ 20890881 (+) True XLOC_003405
TCONS_00008589 lncRNA downstream 895056 20928241 ~ 20930324 (+) False XLOC_003407
TCONS_00008588 lncRNA downstream 895056 20928241 ~ 20930324 (+) False XLOC_003407
TCONS_00008587 lncRNA downstream 895056 20928241 ~ 20930324 (+) True XLOC_003407
TCONS_00006682 lncRNA downstream 1152284 21185469 ~ 21186684 (+) True XLOC_003413
TCONS_00006664 mRNA upstream 421710 19603251 ~ 19611356 (+) True XLOC_003400
TCONS_00006663 mRNA upstream 521518 19502297 ~ 19511548 (+) True XLOC_003399
TCONS_00006658 mRNA upstream 561308 19271557 ~ 19471758 (+) False XLOC_003398
TCONS_00006659 mRNA upstream 561308 19273780 ~ 19471758 (+) False XLOC_003398
TCONS_00006660 mRNA upstream 561308 19370447 ~ 19471758 (+) False XLOC_003398
TCONS_00006669 mRNA downstream 23547 20056732 ~ 20059407 (+) False XLOC_003403
TCONS_00006670 mRNA downstream 23997 20057182 ~ 20059403 (+) True XLOC_003403
TCONS_00006671 mRNA downstream 337994 20371179 ~ 20374779 (+) False XLOC_003404
TCONS_00006672 mRNA downstream 338021 20371206 ~ 20826753 (+) True XLOC_003404
TCONS_00006673 mRNA downstream 862937 20896122 ~ 20898074 (+) False XLOC_003406
TCONS_00006652 other upstream 942254 19060099 ~ 19090812 (+) False XLOC_003396
TCONS_00006645 other upstream 1356509 18676442 ~ 18676557 (+) True XLOC_003392
TCONS_00006630 other upstream 2048292 17964689 ~ 17984774 (+) False XLOC_003382
TCONS_00006627 other upstream 2519434 17441957 ~ 17513632 (+) True XLOC_003377
TCONS_00006626 other upstream 2521329 17441887 ~ 17511737 (+) False XLOC_003377
TCONS_00006677 other downstream 1019043 21052228 ~ 21052344 (+) True XLOC_003409
TCONS_00006686 other downstream 1617337 21650522 ~ 21650638 (+) True XLOC_003418
TCONS_00006698 other downstream 2680830 22714015 ~ 22714131 (+) True XLOC_003425
TCONS_00006700 other downstream 3364085 23397270 ~ 23397385 (+) True XLOC_003428
TCONS_00006723 other downstream 4145638 24178823 ~ 24178938 (+) True XLOC_003444

Expression Profile


//