RNA id: TCONS_00006686



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006686
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_003418
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 21650522 ~ 21650638 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gacCACAGCCATTTCACCCTGCAGTCTAAGACCGGTTACTCATTGAATCTAAGCAAGGCTGAGCCTGGCCAGTACCTGGATTggggaccacatgggaaaactaggttgctgttgaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175953

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008592 lncRNA upstream 23109 21612671 ~ 21627413 (+) False XLOC_003417
TCONS_00008599 lncRNA upstream 23109 21612777 ~ 21627413 (+) False XLOC_003417
TCONS_00008591 lncRNA upstream 241688 21406687 ~ 21408834 (+) True XLOC_003415
TCONS_00008590 lncRNA upstream 343760 21302712 ~ 21306762 (+) True XLOC_003414
TCONS_00006682 lncRNA upstream 463838 21185469 ~ 21186684 (+) True XLOC_003413
TCONS_00008600 lncRNA downstream 252039 21902677 ~ 21903694 (+) True XLOC_003419
TCONS_00006696 lncRNA downstream 946088 22596726 ~ 22599593 (+) True XLOC_003423
TCONS_00008601 lncRNA downstream 1269831 22920469 ~ 22927188 (+) True XLOC_003426
TCONS_00008603 lncRNA downstream 1943711 23594349 ~ 23597671 (+) False XLOC_003430
TCONS_00008602 lncRNA downstream 1943711 23594349 ~ 23597671 (+) True XLOC_003430
TCONS_00006683 mRNA upstream 51995 21586335 ~ 21598527 (+) False XLOC_003416
TCONS_00006684 mRNA upstream 52114 21587950 ~ 21598408 (+) True XLOC_003416
TCONS_00006681 mRNA upstream 511019 21137948 ~ 21139503 (+) True XLOC_003412
TCONS_00006680 mRNA upstream 550739 21096339 ~ 21099783 (+) True XLOC_003411
TCONS_00006679 mRNA upstream 564268 21076872 ~ 21086254 (+) True XLOC_003410
TCONS_00006687 mRNA downstream 259705 21910343 ~ 21962834 (+) False XLOC_003420
TCONS_00006688 mRNA downstream 260114 21910752 ~ 22094392 (+) True XLOC_003420
TCONS_00006689 mRNA downstream 459249 22109887 ~ 22165841 (+) False XLOC_003421
TCONS_00006690 mRNA downstream 483902 22134540 ~ 22169026 (+) True XLOC_003421
TCONS_00006692 mRNA downstream 723781 22374419 ~ 22582127 (+) False XLOC_003422
TCONS_00006677 other upstream 598178 21052228 ~ 21052344 (+) True XLOC_003409
TCONS_00006668 other upstream 1617337 20033066 ~ 20033185 (+) True XLOC_003402
TCONS_00006652 other upstream 2559710 19060099 ~ 19090812 (+) False XLOC_003396
TCONS_00006645 other upstream 2973965 18676442 ~ 18676557 (+) True XLOC_003392
TCONS_00006630 other upstream 3665748 17964689 ~ 17984774 (+) False XLOC_003382
TCONS_00006698 other downstream 1063377 22714015 ~ 22714131 (+) True XLOC_003425
TCONS_00006700 other downstream 1746632 23397270 ~ 23397385 (+) True XLOC_003428
TCONS_00006723 other downstream 2528185 24178823 ~ 24178938 (+) True XLOC_003444
TCONS_00006731 other downstream 2688724 24339362 ~ 24345423 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006732 other downstream 2688736 24339374 ~ 24345421 (+) False XLOC_003446