RNA id: TCONS_00006700



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006700
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_003428
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 23397270 ~ 23397385 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATTaaagccatatcacactgcagcCCAGGACTGGTCGCTCACTGAATCTaaacagggctgagcctggttggTACCTAGATGGGAGCCCACTAGGGacaactaggttgctgttggag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176052

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008601 lncRNA upstream 470082 22920469 ~ 22927188 (+) True XLOC_003426
TCONS_00006696 lncRNA upstream 797677 22596726 ~ 22599593 (+) True XLOC_003423
TCONS_00008600 lncRNA upstream 1493576 21902677 ~ 21903694 (+) True XLOC_003419
TCONS_00008597 lncRNA upstream 1638245 21612707 ~ 21759025 (+) False XLOC_003417
TCONS_00008603 lncRNA downstream 196964 23594349 ~ 23597671 (+) False XLOC_003430
TCONS_00008602 lncRNA downstream 196964 23594349 ~ 23597671 (+) True XLOC_003430
TCONS_00008604 lncRNA downstream 498144 23895529 ~ 23902690 (+) False XLOC_003432
TCONS_00006707 lncRNA downstream 498155 23895540 ~ 23913499 (+) True XLOC_003432
TCONS_00008605 lncRNA downstream 618450 24015835 ~ 24022124 (+) False XLOC_003436
TCONS_00006699 mRNA upstream 100078 23265157 ~ 23297192 (+) True XLOC_003427
TCONS_00006697 mRNA upstream 766881 22623284 ~ 22630389 (+) True XLOC_003424
TCONS_00006693 mRNA upstream 812818 22374419 ~ 22584452 (+) False XLOC_003422
TCONS_00006695 mRNA upstream 814835 22374753 ~ 22582435 (+) True XLOC_003422
TCONS_00006691 mRNA upstream 815143 22374419 ~ 22582127 (+) False XLOC_003422
TCONS_00006701 mRNA downstream 172484 23569869 ~ 23571593 (+) True XLOC_003429
TCONS_00006702 mRNA downstream 307025 23704410 ~ 23884805 (+) False XLOC_003431
TCONS_00006704 mRNA downstream 363085 23760470 ~ 23879647 (+) False XLOC_003431
TCONS_00006703 mRNA downstream 363085 23760470 ~ 23879647 (+) False XLOC_003431
TCONS_00006705 mRNA downstream 363121 23760506 ~ 23881332 (+) False XLOC_003431
TCONS_00006698 other upstream 683139 22714015 ~ 22714131 (+) True XLOC_003425
TCONS_00006686 other upstream 1746632 21650522 ~ 21650638 (+) True XLOC_003418
TCONS_00006677 other upstream 2344926 21052228 ~ 21052344 (+) True XLOC_003409
TCONS_00006668 other upstream 3364085 20033066 ~ 20033185 (+) True XLOC_003402
TCONS_00006652 other upstream 4306458 19060099 ~ 19090812 (+) False XLOC_003396
TCONS_00006723 other downstream 781438 24178823 ~ 24178938 (+) True XLOC_003444
TCONS_00006731 other downstream 941977 24339362 ~ 24345423 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006732 other downstream 941989 24339374 ~ 24345421 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006735 other downstream 942000 24339385 ~ 24342063 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006738 other downstream 942011 24339396 ~ 24340731 (+) False XLOC_003446