RNA id: TCONS_00008609


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00008609
length 19522
lncRNA type inter_gene
GC content 0.35
exon number 1
gene id XLOC_003440
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 24061156 ~ 24083588 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTTTGCTAGGGGAGGATTGCGAACACAAAGCGTGGCGTTTAATGGAGAGGTTTTAGGCGGTTTTAAACAGTAAACACGCCGAACTGACCATAAAAGCTCGACTCTGTGGAAAAGCACCGAGTATTTTGTGCACACGTGTGCTGTTGATAGATTGAAATTGAACAGCGAGCTAGGGAACATAACGAAGGAAATAATGTGGTAATGTGTTCGTGAAAGGGTAACCCGTGTTATGTTGCTGTTTAAACGTTATGTTTGTCCTTTTTTAGCCGTTGTGAAGATTAATGCCCCACCCCTGTGTATGACTCAATACCAATGGTGGTGTTACACATCAAGTGTTTGTCAGGCTGACATGCAGGTAGATGTCTGATAAAGAGAAACATATACCTCATTGGAAAGATGGGCTAATAGATGTTAAATTGATGTCAAATTGAGACCTCGTTGAAATGCAAATATAGCCTattaatcagattatttattatgatttatttaatatacacTTTTAAACTCTTAATCAGTGTAAACATTCAAAATGTGCAAAACAGATTGActgacatgctttttaaaatatataaattctgTTTATAGCAGCTGCTAAATATTTCTTATAGACGCCATGCTTTGTGTTGCAATCCATCTCTTGCGAACTTCATCAGTAGTGCATACTATTGCGAAGATCTGTACTAGATGTCATCAGACCCGATGGCGACATACAGGTAGATAAATCTggaacaaaacagaaaaatatgCACCCTGTAGGAAAGAAAATATGCTGTGCCTCATTTCAAAGCTGCACGCTTTATCAGCTGTTTCActgaaaagtaaaaatgaaatgatTGTAATGTACACCTCAGGAATGGCAGTACATTTCTATTAAACATTCTTGATGACATATGCGGGTGAAAATGTGACCTTCTGCAGGTCCTAGCTTTGATGCAGACAAAGCTATTGTTTATTCTGAAAGAACACACTAATTTGAGCGAACCAAGTCAGACATTTCAATGATAACTCAAACATTGTTTGTTAAATTCTCCCCAACCAATCATAATGTTAACTACAATTTTACTTGCAACTCATTTAAACCTCCTCAAAGCAATTCAAATTTCCTTGCTGCAATCATGTTTAGTGAACTAATAACAGTTTATACGAAATCTCAACCTAATTACAAGTTTTTGCAAATGCAAGTTGTTTTATTTCTAACCTATTTTCCGTTTTAGGCTGTATTATTGCTGACGTTCTATTTATTTGCTACACTGGATGTTTACTCTTTCACAGATGACCTACAGTAAGCAGGTTGCAGTGACAAACGCTGTAACCCGAGGCAGGGTGCACCAGGCAGTCGGCAGGATGCCTCCACAAAGCTCATGGTTTCAAGTTGAGTCAGAGGTTTCGTGTGTGGGTGGAAAGAGGTTTCCTGGGCTGTTCCACCATCAGAGGCCTGAGTGGGAGACCAACCACTCCTTAAAAtggaaacatttctgctgcacgGTGCGTTTTAGTATTCAATCTTGCACCTCTGCTGCCCAAAAGACACCATATGCAATTGTTTGAAATACACCAAATTAGGCAGATGGATATTTAAGGGGTTTTCGTTTAATTTATTCCTCTGATTTTGTAACCATGGATGAGTcacaacatatttatatatattaccaTCTGAAAGTGAAAAGTGTAGTCCAGTTCCTCTCCATATTTACAGAGAGGGAATTGTTAGGCTGAATATGACTCTATTTCCAAGAAATCTCCTTCCTGTCTGTGTCTACACAGATGTCACACATGCTGGATTGAGACATATTGTCACCATGGGAACAAGCGACGTCCTCACAAAGGCTCTGTCTCATCTTGATGGACACTAATGGTGGTTTACCGACATGGAAGCGCTGGTCCAAAGTGATCAGGAAGTCATGAATATCCTCCCTTCAGTTTCCTCCAGCTGATGACATCCTTTGGTTGAAAAGGgtacatttgttttctttacatcTCTATTCATTCTGGCCCTTTTAATTTGTCTTTAACACGTGCAGACACAAATAGAGTCGACCACAGACATGTCACTGAATTAGCCTAGTTTAGGAAAAGGGACAGACCTGTATATCAATGTCTAAGTGGATTAGCTGTGTGATTGAGTGGGTTACACTATAAGCTCACAGATGTCTCTCTGGAGACTGGCTCCACCACTTCCGCAACTAACTGACTAATCTTGTTAGCAGCAATGCTATTAGCATAACAAAACACTTAAAAGAGACCATTTGAACTTCACTTTGCTTCTTTTTTAACTATTTAGATGTCAGTGATACCAGTGAAAAGCTCAACTCAGGCACTGTTAAGACCTGGggtttaaatgtgattttatcaATCCAGTCACAAATGCACAGACACTAAATACAGAAGTAAGTGGTGGAAATTTGACAGGATAAATGCTCATTTGGAGGAGTGCAGATGGTTGAACACCACAAAAACCATCTCTCTGCCCATTGACCTAATTCTTAAACATCACTGGACACGTTGTTGTGCACTAGCACATGCAGGAATGTCAGATGTGATCctaacacactcaaaaaataacaataattcttGGTCATtgtgtcaaatatggacaaacataagtgatttttttttcagattatattGCAGtttatattacacatttttacCCAGTGGTTGGGTTTATTCACgtttgacccaacattgagttAAACAACCCAGAATTCTTTAGATTGCACAGTGTTTAGTGTAGTTCTGTGGTGACAAGAGCAGAAACGAAAGCTGCTGCTCCTCTCTTTGTTGTTAAATTGGATTGAAAGATCAGACAAGGCATGTATAACCACCCATAGACCCCTTCTGTCAAAGATACCATTAAAGTCATTAAAAGTGTACAAATTTCGAGGGGGGCTTACTGCCGAGTCACATGGGTGACTCTGCAGTGAGTACCACTTGCAAATTTCAACAGTAAAACTGAAATATCCAGTCAGTGGTGTTAAAAACACAGCTGTTTTATTAGGCAAATGTGTTTCAGGCAGTTATATTGCAATGATTGCTGTACGAATTAGtagttttatttcaaaaagaTTAATGagacttttgttttatgttgCTTATTGTATGAATCATATAAATAGATAGTCCAAAAAAAAACTGGGGGGGTCCATGTTCAGTTTTATTTAAGATAGACTAACATAAATCTGGCTACATTTTAACATTGGTTGCATTACAAATCTTAGTAGTATCTGGTGAGTGAATAGTCTATTTCAGTAGTGTGCATGTAGTATTGGTTAATATTGGTTAATATACCTACTGATGTACAGTTTACCAATAAATGTTTGGTGAGAGATGCCAATAGTTTAATGCACTAATACGTTTGAAAATAATgtaccaccttccctaaaccttagtaatagtaataataaaaatatgatgaTATTGTGACTTTCATTTAAGTTACATATTCTgaaaagtaaaaatgaataaacttACACCTCAATAATCACTCGCAATAGATACAAACTCAGGGAGTGGTCTTGTGAGAGATTGGTGGGCGATTCTCATTTCTCACCAAAACCAAAATACTCCCCCATCAGCATAACAATTAAACATCACAGAACAGAAAGTGCTTAGAAAGAGGATTAAGCAACTGGCGATTGGTTCATTTCTGATTATTAGCCTACTTTTGTAGCTAATAGTAACACCAAGTCTGGAAGATTGTGTCACTCTTGAGTAAGCTCTTTTAATGAAACCATCACGTGTGCCTGAACAAGTGATAGATAGAAAGCAGTCAGCAGGTTATTTCCTTTTTAAAGGCTCTCTGTGGATCATCCGCTGTTTTTGAAAGATTGTGAAAGTCTGAATTCCTCAGCTGTGAGCGGTCTCTCAAATAAACAAGTTACTCAGAGCTTTTAATGGCACATCCAATGGCTTTGTGCTCCTGCTTTGGGTCCTTAGAGTGGTTTTAAATGGCTTTGTGGGGAGaaaaaactaaactctctgcATCCATAATATGAGCTTTAGTGGGGGAGTCATTTGattcttttaaactgtttaacggTGTTTGCTATGTGTATTCAGGATCTTCTTCGGTGCTCTGTAAACAGACCTCCACCCTATCTTTCTAGATCACAAGTCTAAAAGTGGCAAGTCTTTTCATTCCTAGCAGTTAAGTGTGCTCTCTGTAGTTGGGCCCAACAGCCCTATCCCATTTCAAAGCTTAACTGCGTATTGTGTGTGTATTGACTGTATTGACCCCTTAATGGGTCATTAATGGACCAACAAAAGGATAAAAGAGATTCTTTTCTAACCCCTACTTCTTGCTTTCTAAAATAAACAGCTTTGTCACATTATCTTGCTATCATATATGGACTATGTGCTAaataatacagttttatttttgcattCTGGTTTCTCAATTCCTAATAGGATCTCGTGTAAACATGTAAGTGTGTTTATATGGACTTTAATTAGCATAATGAGCTGATTTGGAACATAGATGCTACATATGTAAGGCAGTTAAGTGATTTCACAGCCTCTATTATATaagtcaatattatttttatatatgtgtaattttgtgtttaattggtTGACAAGCCTTgtcaaacaagcttttattttttttatgatgttttgACCATGCAACCAAATCTAAATTGACTTAAATTCTTTCAAGATATTACTACAATTACTAGTAAATCTAATAAATTCAAGAGTAAAGCTGTGTATTTActtataaaatgttgtaaattgtAACAAAACTGGGTGAGTGTCAGAAATGGTCAAACATCATGACTGACTGAAATGAACAATGCTCACAGGTTTATTACTAATGACCTCTCAGATGTTTATATTGCTTGTTCCGTCCAGCCGTCTGTTGACTGTAACCAGCAGGTCTGGCTGCTCTGGAAGATTTTGTCCTTTTAAGCCTTCGGTCTCTTAATCACTAAGCTATTTTGGCAACAGCTGTTCTGAGACCTGAATAAATTGAATACTTCCGTCTGGACTGGGCTTTGTGTCTCTCCTCCATCCAGcccacttctctctctctctctctctctctctctttctctgttgaGCATTAAGAAACAGAGTCCAAGCTTGTAATCAAGGACATCGTTAGTTTTATATGGGCAACAGTGGCAGACCTAGATCAGTTGTGACCCATAAGCAAGAGaagattattttatttgcatatatgcaTGGTAAATAAGTTAATGTCAGTGTTTAATAgattaaaatattagtttaaaagccttacaaaaatgttttatctaTAAGGATCCCAATAAATGTTACTGTCTCATTATAAAGGATTtgtaagtttcatttaaaagcaacttgatatatattagaaaaaaaaaaataaaataaaataaattgaattggaTAAGCAgttaaatgtgtataaatatgatATTTACATGCAGTTTGGAGGATTGCTAACAATAGAGAAATAAGCAtacaataatgatgataattttTTATCTGTTTGATTATAAATAAAAACCAGTATGTGTTTGCACATGCAGTTTAAATGATCAAATTATGGTTTGAAACACTTTATGTACATACTGTAGTGCATAGTGACCATATAAAATGAACTCTGATGTCCTATTTGGAGTGAAAAACGGCAAACAAAACACTGACAGCCACAAATAAAAGGTATATAAATATAATGGTTACATGCAGTTTGTatggttattaaaaataaagaaattggcATATAAAATCATAAACATTTCTATTTGATTATAAATATAAACCAATGTTTATGTGCAGATGCAGTTTAGATAATTAAATtatggtttaaaatgttttatgtacaCACTTTAGTGCATAGTGAACATATAAAATAAACTCTGATGTCATATTTGGAGAGAAAAGCAGCAGACAGAACACTGACAGCCATGAACAAACCTCAAATCCAAATCTGAATATGACCTGGACATAGAAACAAACAAAgagacaatcaaacaaacaaaatattaataaataaatctgcatttaTAGAGAACAGGATCTGCATACCTCAGAATAGTCTTCTCAAAAAAGTTTAACAATGTCCCAAAGAAAGGGTGCACTGAATATTGACTTTTGCCAGGAGAGAAAAACAGTATACTTGTTTATGAAGACACAATAATGTATAACGACACGGTATGACCTAGTTGTTCTCTATTagggtggtttacaaggacatgcattgtgtcctcataattcaaatgCTTAAATATCATACTTAACAGGACTTTGACATTCaaattttgccacaggtttcctgttGAGGTTAAGGGTATAGTGCAAGGCCATATGATGAGcagtattgtattatttatttgttcatttgatcATATTTGCAGTATAATTTACATTACACCAGTGgagtgtcctcgtaaaccacatatATTAGTATATGTGTCTACCTTGTATTCCTCTTGTTGTACAGACCAAAAGTATAGCAAAACCAGTAGATTTTGACCCTGTGGTTTCATTTTTTATTCCCCATGaggaaaacggctcataaattaaacagaataaagtattTTGAATTAGGTTACGGTTATATAATATAAAGTCTGTAgtgtataaaaatcattacatgaaaaatccccataaagatagctgtattTTATGTTTGTATCTTACATAAAGTATAAGAGACTAAACATAAGTATAGTCATCAAAACAAAGATGTGGTGTTGGCGGCCTgagatatttgcatatttgagTATGCTGTGCAtatatgaacaaacaaacaacaacatttattttcatatcaTGTATTTTGAGGTTGTACATGCAGTTTGAATGACCGTGGTCCTTCAGCTTGGTAACTCAAGCTAGCTGACGCAGTGATAGATCAACCTCTTAAGTGTCAGATCTAAACATAGGTGTCCACTGCCTGTAAGAAGTGTTGCTGTCAGACCCTCTGGTTTATAGTGTATTgcataataaatgtacttgccTAAATATGCAGCATGATTAAAAATATCATCACTATGGTGATAAGTGTACATAGTTCTTAAACGTAGGCTTTCTTCCCTAGCACAACACACTCATCTTTTGATTTAAAGAAATGGTAGTGTTGAGTGAtatattatattcaaaacttgcttgacaatttttttttttggtgttgttcATTTGATGTTTAGTTCAAGTAGAATATAAGCGACAACTGTTTTCTCTATATGTGTCACCAGTGTTAATTATAAAGGTCACTTATCATCAAAATCTTCATAAAAATACACCTAGTGCCAAGTGCATGGGTAGAGAGTAGTGTTTATGtggtctctctgtgtgtgtgtgttgcagaaaCAACCACAGTTTAtttcagatcagcccgtctgttATCTCCTTTGCTGTTTCCCAGTAGTCCGAGAATGGCCTTTACAGTTAGTTGCAATTTGCTGATGTCATCTAACTTAAATGACACTAATGTCAGGGTCATTTGCACATATACTTCATCTTGATCATATATAACAGGAGTTTGATCATAATATGACTCGTTTTATATAGCTAGACACTCTAATACAACTAAACAATGTGAAAGATTGATAAAGTTGCATTTAGAGTGAATTACAAACAAAGGCCTGTAAGTATATGATTATGAAGGTGTTTTGTGTGAACTGCTGAACCTGCAAAACAGTCTAAGGTTGTGTTATAATTTGCTGAGTCACTGAGGCAGATTGTGGTTTCAAGCAGCTGTACTACAGCACTAAACCAATAAACTAGAAGGAACTGGGTGCCAACTGAATAAAActacactgaccggccactttattaggtacacctgtccaactgcttgttaatgcatatttctaatcagccaatcacatggcagcaactcttaatgcatttatgcatgtagacatggtcaaggcgatctgctgcagttcaaaccaagcatcagaatcggGAAGAAAGtgcatttaagtgactttgaacgtggcatggtttttttgccagacgggctgatctgagtatttcagaaactgctgatctactgggattttcatgcacaacaatttctagggtttacagagaatagtcagaaaaagagaaaatatccaatggtctgtgggtgcaaatgccttgttgatgtcagaggtcagaggacaatagaggattggagaaacattgtctggtctgataagtctcgatttctgctgctacATTTGGATTAAAGGGTCAGAATTtatcatcaacaacatgaaagcatggattcatcctaccttgtatcaatagttcaggctggtgggggtggtctaatggtgtgggggatattttcttggcacactttgggcccattagtaccaattgagcattgtgtcaatgccacagtctacctgagtattgttgctgaccatgtccatccctttatgttgacagtgtacctatcttctgatggatagttccagcaagataacgcaccatgttataaagcgcaaatcatctcagacggattttttgaacatgacaatgagttcactgtactcacatggcctccacagtcatcagaactcaattcaatagatcacctttgggatgtggtgaatgGGAGATTCTGTCTatcatgatgctatcatgtcaatatagaccaaaatctctgaggaatatttgcagtaccttgttgaaaatgtgccacgaaagattaaggcagttctgttggcaaaagtgggtccaaccgagtactaataaggtgtacctaataaagtgtatatgcttttttttcttcaacactTCTCATCTTTTATGTAATAAACATATGAGCAAGACCATTTCTGATTTAATAAACATTAACCTGAATTTAGATGTATAGTCCATCCAAATAttttttcatcaaaaaaaaattataataaataaatatatatatatatatgcagttgaagtcagaattattagcccccctgaattattagcgcccctgtttatttttttcctcaatttctgtttaatggagggaaggtggtttcagcacatttccaaacataatagttttaaaaaactatttctaataactgatttattttatctttgtcttgatgacagtaaataatattttactttatatttttcaagacacttctatacagcttaaagtgacatttaaaggcttaactaggttaaaaaggttaactatgcaggttagggtaattaggcaagttattctataacaatggtttgttctgtagactatcggaaaaaaaaattgcttaaaggggctaataattttgtcccaaaattgttttttaaaaaattaaaaactgcttttattcttgctgaaataaaacaaataagactttccccagaagaaaaaatattatcagacatactgtgaaaatttccttgctttgttaaacatcatttgggaaatattaaaaaaagaaaaaaaaaatcaaaagggggctaataattctgacttaaactgtatatatttgttttttttttattttgttttgtttttttattctcaaAGTAACTGACTTACACTTTAAACTTTATGGATAAACAGTAGTTATTTAATGATCtagaaaaaaagtcacctacatatTGGACAGCCTACAAATCAGCTATTTTTAATCAGACTAAAGTATCATCTATTCTAGATGTTTGATTGGATGCAAAAGCTAAGCTAATATTGGATAACTTCTCGCTATGTACTATCACGTATAGGAAATGTGACACAAAATTACCTAATTGATTAACTTCCCATTCCACTGCGTAGAAAGTCTGTATTTAGAGGAAATTTAAACTGGACTATTACTTAATCTTCCAGCAGACGAAAGATCGCTTGCCTTAGCAGTTTTCTCAAACTTTCTCAATACAGCATTGAGTCTGTTCCACATTAACGTTATAGTCATACATGAGTGAAATAACTGAAACTCTTAAGACAAACATGAGGATTTGAACTTTTGTATATCAGAAGAAACAGTGGAAAGTCATAACCATCGATGCTGAGTCATTTTAGCAGTGTCATACATTTTCTGTGGTGTGACCTACTTCTGTAGGTTTCTGGTTGTTGCCCTTCGTgtagtttttaaatatataatgaattaaaatggtatttaaatgaATTACTCATTAaagcaaatacaaataatatatatacaaatatattcaaCAGCTTTTAACTCCTCAGTGTCACTATAATTCACACATTTATGAGCACTGTGCGATCATACCCCAGATGCCTGTTGGCCCTGTAGCCAGTCTGGTGGAAGGGGTGGTTCatatttctcaaaaagtggacattTATTAAGTTGTATGCctcattttatgtttaattaagagatttaaataaattttaagcactatttttagctgaatttgctatcataaccacactttttgatataCCAAAATATTTAGAgtcagaataaagaaatatgaataaatacctatttttaaaacacaaacttAATACATTGTATGTcattagaaaaatattaatagaaaaatatttgaattttaaatgaaaaacaagcCTATTGTTCTTTATTAggcaaattataaataacaaactggcTAGCACATAATGAACTTTCTTCAGTGAGAATTTGgtcatttgaataataataataataataataataataataataataataataatattaataataatgtagagcttcacaatttttgtagcctctagaaaaaaaaaaatcatattcataaaatatattcatataatatatattcatataatatatatggTTCGAaccatctaaaatatcttaatttttattCCAAAGTTGTGAGTAGCTGACTAGATATTTACATTAACAAGTAGTTTAATCACTGTACTAGTAAAGTAGCCAGTGCGTACACTGTTACCAATTTTCTGCAGACTCTACTGTAACTTACCTGCATAAATAAATTGCagctaaaatactgtatttattgtacatttacaaTACCATCTTTATGTATGTGTAATTACAAAATGgtatgtatatctttactgtaaatgtacagtaatattcacaatgcaactttaaagtacagtaacatactgcaaaaCCGTCTAAagacagtaaaatacagttcatattacagttaaatactgtgtgatTTACAGAAATCAGTAACAGTGTATATGTGAAAAAGCCTGGAAATGCTACATCACAGACaattatattcaaattaattataatttgatGGGTTTTCGATGgtatattttcactatttatgatggcaaagTAGTCAAAATAGgataaatgagctcatgtatgggacaagcAATTCAGTGGTCGTATTAGTAAAGTAGCCAGTGAGTAACAATTTtatgtagaatctacagtaacttactcaCATAAGTTAATTGCCGCTAAAATACTGtattaattgtacatttacagTACCATACTGctgtatatataattacaaaattATATGTTTATATCTTTAATGTAACATATACAGTAatgttttcaaaatacaataaaatacagcaaacctgttctacagtaaaatacagttcatgttACAGTTACATACTGTGTGATTTacagaaattatatttattattaaattaacagTGCCTACATGAAAAAGACATCACAGTCTGCCTTTAGCTGGCCTGCCTcatttaataaaagtaaataccTAGAGCAAAATGCATTAATCTTTATTGGccaatgaaaaaataaaagtttatatataacGTTTTTATAGTTATGTAAAGCACAGTAAAGCACTCTCTTCAACCCAGATGTTACAAAAGCCCTGTGATAAACATGAGCTGTTACAAAAGCATACTGAGTGAGATCAAGATAATTGCTGCAGTATATGCAGCAGGGTTTTCCTTGAAATCACAAACACTCTCAGCCAGAGGCATCTCCACATTTCTAGCTGAAAGTGAACTCAGCATTAGAACAATCAAACAATGTGTTCTCTTTTCCATCATATAGCAGAGTGAGCACATGACTGTTAAGAAACTGCTCCTTTGCAGAGCACAGGCGTGGGTTATTTATTCTCTTGCATGAGTCAGCCACAGTTTCTTACTTTCTTTAGCAAGGCATTTCAAAAGACACAACATTTGTTTAGTACAGATTCGCTTGCAGACGACAAGAAAGTACGACCAGTATGTTCTCATTGGGATCTCATAATATTCCCAGCTTCAAGTGGAATCAGTATGATTTGTTTGACAGCGGAAGTAACAAACTTTAAAGCCTAAAAGAATGCAATAATTCTTGCGATGCTGGTTCTGTTTTTATCATATTCTTGGTCTGCCTTCATGGGCCACTGCTATAAAGCTATATTGAGCGAGACACATTGCAAATTCCATCCCACTCCCAGACACGTAAGCAGCTTTTTTGAGTCAGCTCCGTTTCTCTCTGAATCACATGCCTTTCATAAtaaatgtgatgaaaccagaggGCAAATGAAATGAGTCAAGCATTAGATGACATTAAAGTTTAGAGAGCGAGGCAGGAAAACAAGGTGAAAATAGAAGGAAAGTCTAAAAGTTTTATGCTCATTACTCTCGTCTGGAGAGAGAAATAGTTGTCGTTGTCACAGTTGCAGCCCTGTTTAACCCCACTGAGATGAGGAGCACGGAGGTTTTCGCAAAGCAATCCCATCCTCATTAATTGCCAACGTCCCTCGACACTTTATTCTCTCATGTTTTTTCCCCGTCAGTTCTTTTGCTTCCTCGTGCAGCTGAAGTGCAGGCTTGtgctcatttaaaatgtttgaagTTAATTATTTTGGAGGATTTAAACATTAACAGGTTTTCCTCATAGTGTTGCTTTAGGCAGCTGTTGGTTGAGTTTTAGGTCTTTCTGACTGAACATTGGTTGGAGTTCCAGTCTGCGAGACCACAAAGGTTGAGCTCATGTGATCTGCTGTTCACGGCCCGGTGACCAGCATtagtggagagacagagagaaacacaTAGGGAAGGTGTGGCTCAGCGGTTACTGTCATGAAAGAAGGAATTCTTTTGTGGTGACACTAGAAAATTTGGGAAATTGTACTGCTTAGACAGCAGTCTAGGTTggcatattttttttcctttagaaTCAGCATACAACATTTTGCTCTCCATATATTGGTAATCATTTGAGATTAAATACAATGAATACGTACTGtacataaatatgaataaaatacatttgatatattcaaatacaaataattcaatttattcaattttaaaatattaagtattcaatttttaaaataaaaataaaatatattaccaTATGAATAAATATCACCTTTTTGAAAACAGTTGTACTGGgcttgaaattttattttatttaacagggacaatgctcattaataataacagtaaaactGCTAATAAGAGTCGGCGCCCATAGCCTAGTGGTAAAGTGTGTGGACATATAGTGCTGAGGTGCTCATGGCAACCTGAGTTTAATCCCTAGCTCGAGATCCTTTGCTGATGCTTCCCTCTCTCGCTGCTCCCCATGTATTCCTGTCTCAACTTCACTGTCCTatcaaataaaggtgaaataatcattttaaaaaatgtacacaagCCAGATTTagccacaagggctaattttcatctgttgccccTTGCCAGATTTTAAAGGGCCTTGAAACCCCACCACCCACCCaatctcagcagggtgttttcacacctttagTTTGAAAAAAATCAGGAAAGTAGGTGAGTCCAGCACTGGTTAGGTGGGAgtgttaggccgtactcacactaggtacagttgcctcaaaccaggccaaagcacgcttgtctccCCTTCCGTCtcactcacaccatatcgggctctctcactcagcagcacagtggagattcctctagttatatcgtttcagtcgtttgatatgcagtgacatgcagtcaaatatttcaccaaacagtccttagggatgcggtgacacgcagtcagatatttcgccgaacagatccgccacttttgccgctcataaacaatcataatgttctcgtgctgcaggaatgtggaggtttgctgaaggcgtgcagctgttttgcagtgaggggtttgcgtctttaataaactacggcagtttgcgttaaCTGAACAGTAAGAAAGATTAatgaatccatatgaaacagtcccttaaaagtcacgtctcgctttcagtttcgggctttggcgcgttttgcactcacacgcaagcgtaccgcgccaaagcccaagtgaaccgcgctcaggcccacctcttccaaccgggccagggccggccaagtgaaccgtgcttgagcccgattcagcgcacttacacttctcaaacgatctgggaaatggGCCtaggcacggtacggatggcagagtgtgagtaggcccttaagtggcgaaagagggaagggtttgcataaaaatgggagtttttgGTTCGagcacacgctgattttcacagaggcaaaacaacacatagacgcaggggagaaagacaatGACTGTtcacatggacatcagtattcAAATTGTTTGccaaattgtttattttaactgcagttgggactttcactttcattcagaaacgTTTCttgcatgcccccgtgacaaacgagatattatatgcgaggaattgctggaagaatgcagttttaataaaatgtttgaaaCCGCACAGcgattgagagaaaaaaaaactctgcatttcttgataacttagatgcactcggtaggtagcgtcagaaagccgtgtacaaaatgcagcaaaaattctacacaacagtaatagtttgattaaggtgtttacatgtttaccttcagagagcagcattcacagCGGATCTTTCattccataatattgtagtgatattaacgtactgtaaacttagtaacaaAAGACTGATCACACAGTGATCACACACTTACTAAATCTGTAAACACAGggcaatcaacaccaactggaaccacATCTTTTTTAATAGGAGATGAGCGGCAAATCTAGATTTCACCATTTCTAGATTCGAAAAGCTGCAGTATAATAAtgagtattgttcattattagtttattttagttaatacattaactgacattaactaatgaaaccttattgtaaaacgTAAccagatattttagatgaaatcagagagcttcCCCCTCCTCCATAGACCGCAAGGTTCCTGACTCacttaaatacatataaaataccaAAAAATCCTTAAAACAGACTAAATGCCTTTAGTGGTTCAATGGGAATATTGGCAAACTTTGAGAAtctgcacataaaacaaaaataagttcATTCAACAGTTGTGTCATTCACAGCTCAGTGTTAGTATTTCAAATtgaattttttgagtgaactaaccctttaactttTTTCTAATGTGCAACTTTCGCAGGGGTGTAGCAGCTGGGAGGAGCGGTGGGAtatgtccccctcacttttagagacagaccttttagaaacaggtgattaatgaTTATATGAGCGTAAAGTTTGGATCCCATACAGCTGTGCTACGCCACTGACCTTTCATAAAACTTCTTTGGAacgttaattattgtgaaaatcgctatataaataaaataataaaatcccTTGAATTGTATTGAATTAACTGGAAAAGTATGTGTATTTTGTATATGGTAATTGTAtgtataatctgcttgttaagtcatgatgtatgaaatactgtttccaggtctaAATCGCTACTCATTTGAATGGAGAAAATATaagtttatgaccacttttcaGTCATATCACACAATAAGGTCAATTTTATATAAAAGCATGGTGTACacatcagtgtttggactttggacATCGGATATCCCATaaagtttgatagagcgcttttACCCGGAAGTctctttgcgtgacgtcacactttaCCATAGATGGGCCAAAAAAGaatcacaagtaaaaaaaaataataaataaataaaaataaataaataaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaacatctaaagatagaaaaaatatgtatatatgtgtgttgcGAAAAACAATTCAGAGCTTTCTATTCATTTGGAAACTTGGcaaaccaaaacaacaaaaaacagtaTTTACCATCAATAAGCATGATAACCAGCGATGCTGGGAAATTAGAGGAGAAGTGTGCAAACAAGGAACGTGTTTTGCAgcttttccgtttttttttttctctcgcttttttctttttttttggtagcGTGAATATAGGGAAACCACGGCTTCCGctatgtgtttatttaaacatcTGACACTGATGGGCATTTGAGAGGGATTTTTTTCTGGTTATTCGTGTTCTGTTTCTTGGCATTTGTTCTGTTTAAGTAGCGTTGCAAAATCAGTCCAGCTGAAATGCTGACATAATCCGCCGGTTTAATCTGAAGCGTCTTTTGTTGCTGGTATCATTTGAAGATTCCCCTAGTGGGCTTTGCATTTCATTAGTGCAGATATCTGATCTATTAGCTACCGACCATATGGAGCGCATGTCACATGCAGGGGAATGTTTGGGAAGTGAGCAGATCTTGTCAAAGGGAACCCAGGAGACAGGGCCGGGACAGCAGTCAGGACTCAGGATACAATTATCAGGCTTTCCAGTTCAGACAGGCCCATCCTAGAGTACAAGGATTTCCTCCAGGGCTGCATTTCCACAGGCAGCAGTGGGAAACAGGAAGCAAGGAGCCACTGAGTCCTGTACTGCACTCATTCTCCTTTACTCTTTCTCTCTGTTTGCGCTCACACAGTTCTCTTCCTATCTGCGTGAAATGTTATAACCTAACTCTAACTAATGCACAAAGTATTGCTTGTTGTTAGGCACAGTTGAGTACAGAAAGTATACTTCATTTAATAGCattcacaaacacatgcacacttgAAGGATCATTATTGTCCTTGTGCTATTACTCCATGTAAGTTAGGACTGTTAAATGTGTCTGAAGTTGTTAAAAATGACTGGTACATTTTAATCCTATAACACATGCAGTAAACATCACAATTTGTATCAGTTTTACTGTCTTCGgttgtttgttttctctttttctgtctcCTCAATTTCTTCTCAACAGCTTGTGGACAAAGTAAGCAGTGCACAAAACAATTCAATGCAAATATGGAAAAGAATTAGATGTTGCATGCAAGTGTTTTGTGCTGTGGAGAGGCAGGGGCCTCTAATTTTCATAATAGGATTTGAGATggtttaatgataaataaatgttttttgagtTGACAGTCTATAACAATAAATTGTGAAGCTttgtcaaaataatgaatgatgtgCAGTGGCGGAATATTTTTCAACCACgtgacaacagagccactccccacctgccggtagaaacaggtaaaaaaaaagagcaaaaaacggaccccaaacttttgaccggtatagtgtatgcaaaaagaaaaaaaggattttttttcctACTTCTAGTTCAAATATGTACATTTCAAAGTTAAAAAATATCATTTTGCGTACCCCAATAGCGTATAGTTTAGCTTGGTTTAAggaaaaaactcttaattttgacatttcttCTGAGGgtggaaacaaaacaataattttacTTGCCTTTGAGATTTGTTTTGATATTTACATCTAGAAACAATAcatttgtgattttttaaaaaaatatatattttttgttcaattGCTCAATTTCTGCTATTTtgtaaaactgtattcatatcacaatatttatcacagaaaaaaagtattgcaatatcagattttttcaatcgtgcagctctactcaTAAGTGTTCAAAAAGGCAGTATGTTATAGATTTAAAGACACAtctgacccccccccccccccccccccaaaaaaattgcCAATAATTCACTCTTACTTAAGGTCATAAGATGTAGGTGATTTTTTCCCCTAATtagaacactaaagaagatttgAACTTAAAATATGATAATTGGTGATTAATAAAAATGCCAAAAGTCAACAGCAACCTGCTCTTTGAGAGTCCAAAACAACATATACAGGGAAGACTAAATGAATACAGTCAATCTCAAAACGCAAAATGATTtgctgttatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatattatatcatattatattatattatgctgaattatattaaacataaaatatactttagcataaaaataatattttttctaagaTAATAATGAAAATGGAATTTTTAAGGGAATAACAATTATGCAAAAGTGCATTAATTGAAGTGCAATAAATTCATCAAATAtagctgctgttaaaaacaaacaaacaaaaagcaaaaaaaaaaacgttgacaTCAAGAATATTCTACATCCTCAGACATATGGATATACATTAAATAATCTGTTTATCTGGCATGCCTGAGCTCTGTGTCATTTATCTGTCTAACATACAGATATAAGCCCAAACAACATCCTTCCCATCCTTCCTTCCGATTGGCCGACAGGATCACACTAAAATGTCATGACAGGAAGACATTCCGCAGATACCAAAATAAACAAGAGCAAAGTCAGAAACACATCCTGCCATAGAGGAAAACACTCACATATGACTATAAACACAAAACCGCACGCTCAATCCTCACCTTCAATAATTACATTAGAAACTGAAACTTTATAAGCTGGAAAGTCCCCATGTAACCTACTGGTATCTACTAAATGTTTATCAATCATTGACTAAGTTGCCAGCTAAAAATACGGGTAAACCCTGAATGTTAACTTTTGTTTTAATCGCACATGGTAAAAATTCAGGGTTGCTGGGTTTTGCGAAAACAGAAATTATTTTCCTGGAATACTTTATTGTTCAACTGATGGTTGAACTGTTAAAGGGACCATTTGTAGattaaaagtaatataatataaaataatttaatataatataatataatataatataatataatataatataatataatataatataatataatataatatagtttcaAAACATAAAAAGGAGCAGCTACAACATTCTGCTAAACATCTCATCTTGTGTTCCACGTCATGCAGAAATGACAGAATGGTGACAGTAatgctgtttattattatatattttttcagaaagtttttttctttcaagaacATCCATGCACAATTGCTTTCACAGTTTTCCCATTTATGAATAATTTGTGTACTATATGTGCGTCTGTGCCTGTTGGCTAAGAAGACGCTTGTTGTGATTTATGTTATTTTGCATCACCTCTCAGCTCCATTATAGTATTACAGAAGGCTTTTATCATCCCTTCTCCAAATGTAACAGAGGCGCAGCAGTGTCCAAAGACAGCTTGTTAGCTTAGGGTTGTGTCAGCAGGCTACAATGCATCTATCTCTGATGAAACTCTCTGTAACTATGCTTCACGGTGGTATTTATAATACCGAAGGTCGTACTTTCCCCTTCAGTCCTTCTCCATCTCTGTCTTTCTAATCTTTCTGTTCTCCACTCTTTCTGTCACTCACTGAATGATTCTGCTTTCCCCATTGCAGCTCATCAAAACTGCACGCCTGTGAC

Function

GO:

id name namespace
GO:0022402 cell cycle process biological_process
GO:0061647 histone H3-K9 modification biological_process
GO:0006325 chromatin organization biological_process
GO:0034968 histone lysine methylation biological_process
GO:0090304 nucleic acid metabolic process biological_process
GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus biological_process
GO:1901836 regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I biological_process
GO:0140014 mitotic nuclear division biological_process
GO:0008213 protein alkylation biological_process
GO:0006996 organelle organization biological_process
GO:0042790 nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I biological_process
GO:0018205 peptidyl-lysine modification biological_process
GO:0043414 macromolecule methylation biological_process
GO:0007049 cell cycle biological_process
GO:0006479 protein methylation biological_process
GO:0016569 covalent chromatin modification biological_process
GO:0016570 histone modification biological_process
GO:0051276 chromosome organization biological_process
GO:0016571 histone methylation biological_process
GO:0007059 chromosome segregation biological_process
GO:0051567 histone H3-K9 methylation biological_process
GO:0051301 cell division biological_process
GO:0033554 cellular response to stress biological_process
GO:0051052 regulation of DNA metabolic process biological_process
GO:0018022 peptidyl-lysine methylation biological_process
GO:1903047 mitotic cell cycle process biological_process
GO:0006259 DNA metabolic process biological_process
GO:0006260 DNA replication biological_process
GO:0006261 DNA-dependent DNA replication biological_process
GO:0006270 DNA replication initiation biological_process
GO:0032259 methylation biological_process
GO:0006281 DNA repair biological_process
GO:0000278 mitotic cell cycle biological_process
GO:0044422 obsolete organelle part cellular_component
GO:0044424 obsolete intracellular part cellular_component
GO:0044428 obsolete nuclear part cellular_component
GO:0070013 intracellular organelle lumen cellular_component
GO:0044446 obsolete intracellular organelle part cellular_component
GO:0044464 obsolete cell part cellular_component
GO:0015630 microtubule cytoskeleton cellular_component
GO:0005622 intracellular anatomical structure cellular_component
GO:0005623 obsolete cell cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0031974 membrane-enclosed lumen cellular_component
GO:0005694 chromosome cellular_component
GO:0031981 nuclear lumen cellular_component
GO:0043226 organelle cellular_component
GO:0043227 membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043228 non-membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043229 intracellular organelle cellular_component
GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043232 intracellular non-membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043233 organelle lumen cellular_component
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity molecular_function
GO:0016741 transferase activity, transferring one-carbon groups molecular_function
GO:0008168 methyltransferase activity molecular_function
GO:0003682 chromatin binding molecular_function
GO:0003688 DNA replication origin binding molecular_function
GO:0140097 catalytic activity, acting on DNA molecular_function
GO:0016278 lysine N-methyltransferase activity molecular_function
GO:0016279 protein-lysine N-methyltransferase activity molecular_function
GO:0018024 histone-lysine N-methyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03050 Proteasome
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko05169 Epstein-Barr virus infection
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006719 lncRNA upstream 23997 24039133 ~ 24040070 (+) True XLOC_003438
TCONS_00006718 lncRNA upstream 24893 24035804 ~ 24039174 (+) False XLOC_003438
TCONS_00006714 lncRNA upstream 39491 24018401 ~ 24024576 (+) True XLOC_003436
TCONS_00008605 lncRNA upstream 41943 24015835 ~ 24022124 (+) False XLOC_003436
TCONS_00006707 lncRNA upstream 150568 23895540 ~ 23913499 (+) True XLOC_003432
TCONS_00006722 lncRNA downstream 32495 24116083 ~ 24151217 (+) True XLOC_003441
TCONS_00008610 lncRNA downstream 36703 24120291 ~ 24251616 (+) False XLOC_003442
TCONS_00008400 lncRNA downstream 92830 24176418 ~ 24177651 (+) True XLOC_003443
TCONS_00006737 lncRNA downstream 255805 24339393 ~ 24340922 (+) False XLOC_003446
TCONS_00008611 lncRNA downstream 255808 24339396 ~ 24344016 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006720 mRNA upstream 7458 24046179 ~ 24056609 (+) True XLOC_003439
TCONS_00006717 mRNA upstream 19481 24034345 ~ 24044586 (+) False XLOC_003438
TCONS_00006716 mRNA upstream 31877 24027809 ~ 24032190 (+) True XLOC_003437
TCONS_00006715 mRNA upstream 34356 24027715 ~ 24029711 (+) False XLOC_003437
TCONS_00006713 mRNA upstream 56079 24002503 ~ 24007988 (+) True XLOC_003435
TCONS_00006724 mRNA downstream 167553 24251141 ~ 24299538 (+) False XLOC_003442
TCONS_00006725 mRNA downstream 206542 24290130 ~ 24297701 (+) False XLOC_003442
TCONS_00006726 mRNA downstream 214844 24298432 ~ 24310645 (+) True XLOC_003442
TCONS_00006727 mRNA downstream 230343 24313931 ~ 24331318 (+) False XLOC_003445
TCONS_00006728 mRNA downstream 230406 24313994 ~ 24330192 (+) False XLOC_003445
TCONS_00006700 other upstream 666682 23397270 ~ 23397385 (+) True XLOC_003428
TCONS_00006698 other upstream 1349936 22714015 ~ 22714131 (+) True XLOC_003425
TCONS_00006686 other upstream 2413429 21650522 ~ 21650638 (+) True XLOC_003418
TCONS_00006677 other upstream 3011723 21052228 ~ 21052344 (+) True XLOC_003409
TCONS_00006668 other upstream 4030882 20033066 ~ 20033185 (+) True XLOC_003402
TCONS_00006723 other downstream 95235 24178823 ~ 24178938 (+) True XLOC_003444
TCONS_00006731 other downstream 255774 24339362 ~ 24345423 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006732 other downstream 255786 24339374 ~ 24345421 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006735 other downstream 255797 24339385 ~ 24342063 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006738 other downstream 255808 24339396 ~ 24340731 (+) False XLOC_003446

Expression Profile

//