RNA id: TCONS_00006723


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00006723
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_003444
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 24178823 ~ 24178938 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATAGactagctagctctctgcaactcttacatggtcgcccactgaatcTAAGCAGGGccgtgcctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000172131

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008400 lncRNA upstream 1172 24176418 ~ 24177651 (+) True XLOC_003443
TCONS_00006722 lncRNA upstream 27606 24116083 ~ 24151217 (+) True XLOC_003441
TCONS_00006721 lncRNA upstream 95235 24061156 ~ 24083588 (+) False XLOC_003440
TCONS_00008606 lncRNA upstream 95235 24061556 ~ 24083588 (+) False XLOC_003440
TCONS_00008608 lncRNA upstream 95235 24063943 ~ 24083588 (+) False XLOC_003440
TCONS_00006737 lncRNA downstream 160455 24339393 ~ 24340922 (+) False XLOC_003446
TCONS_00008611 lncRNA downstream 160458 24339396 ~ 24344016 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006741 lncRNA downstream 161093 24340031 ~ 24343193 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006743 lncRNA downstream 164072 24343010 ~ 24344016 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006744 lncRNA downstream 164390 24343328 ~ 24344304 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006720 mRNA upstream 122214 24046179 ~ 24056609 (+) True XLOC_003439
TCONS_00006717 mRNA upstream 134237 24034345 ~ 24044586 (+) False XLOC_003438
TCONS_00006716 mRNA upstream 146633 24027809 ~ 24032190 (+) True XLOC_003437
TCONS_00006715 mRNA upstream 149112 24027715 ~ 24029711 (+) False XLOC_003437
TCONS_00006712 mRNA upstream 170084 24001993 ~ 24008739 (+) False XLOC_003435
TCONS_00006724 mRNA downstream 72203 24251141 ~ 24299538 (+) False XLOC_003442
TCONS_00006725 mRNA downstream 111192 24290130 ~ 24297701 (+) False XLOC_003442
TCONS_00006726 mRNA downstream 119494 24298432 ~ 24310645 (+) True XLOC_003442
TCONS_00006727 mRNA downstream 134993 24313931 ~ 24331318 (+) False XLOC_003445
TCONS_00006728 mRNA downstream 135056 24313994 ~ 24330192 (+) False XLOC_003445
TCONS_00006700 other upstream 781438 23397270 ~ 23397385 (+) True XLOC_003428
TCONS_00006698 other upstream 1464692 22714015 ~ 22714131 (+) True XLOC_003425
TCONS_00006686 other upstream 2528185 21650522 ~ 21650638 (+) True XLOC_003418
TCONS_00006677 other upstream 3126479 21052228 ~ 21052344 (+) True XLOC_003409
TCONS_00006668 other upstream 4145638 20033066 ~ 20033185 (+) True XLOC_003402
TCONS_00006731 other downstream 160424 24339362 ~ 24345423 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006732 other downstream 160436 24339374 ~ 24345421 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006735 other downstream 160447 24339385 ~ 24342063 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006738 other downstream 160458 24339396 ~ 24340731 (+) False XLOC_003446
TCONS_00006746 other downstream 401641 24580579 ~ 24581114 (+) True XLOC_003447