RNA id: TCONS_00006865


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00006865
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_003503
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 27520456 ~ 27520573 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctacaGCCcgagaccggttactcactgaagccaagtagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccaaaagGGAAAACTAGGTGGGAAGTGGtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116443

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006863 lncRNA upstream 105982 27403871 ~ 27414474 (+) True XLOC_003501
TCONS_00006860 lncRNA upstream 155500 27363990 ~ 27364956 (+) False XLOC_003500
TCONS_00008620 lncRNA upstream 312070 27207196 ~ 27208386 (+) True XLOC_003499
TCONS_00008619 lncRNA upstream 811376 26702957 ~ 26709080 (+) True XLOC_003497
TCONS_00006846 lncRNA upstream 1121969 26396639 ~ 26398487 (+) True XLOC_003492
TCONS_00006867 lncRNA downstream 104503 27625076 ~ 27649659 (+) False XLOC_003505
TCONS_00008403 lncRNA downstream 104511 27625084 ~ 27649582 (+) False XLOC_003505
TCONS_00008404 lncRNA downstream 104599 27625172 ~ 27647440 (+) False XLOC_003505
TCONS_00008622 lncRNA downstream 117400 27637973 ~ 27647440 (+) True XLOC_003505
TCONS_00008623 lncRNA downstream 208667 27729240 ~ 27731175 (+) True XLOC_003506
TCONS_00006858 mRNA upstream 136724 27274355 ~ 27383732 (+) False XLOC_003500
TCONS_00006862 mRNA upstream 137720 27364338 ~ 27382736 (+) True XLOC_003500
TCONS_00006859 mRNA upstream 145924 27347076 ~ 27374532 (+) False XLOC_003500
TCONS_00006861 mRNA upstream 148088 27364059 ~ 27372368 (+) False XLOC_003500
TCONS_00006856 mRNA upstream 323004 27133560 ~ 27197452 (+) False XLOC_003498
TCONS_00006866 mRNA downstream 22520 27543093 ~ 27545719 (+) True XLOC_003504
TCONS_00006869 mRNA downstream 448261 27968834 ~ 27997774 (+) False XLOC_003508
TCONS_00006870 mRNA downstream 448472 27969045 ~ 28010171 (+) False XLOC_003508
TCONS_00006871 mRNA downstream 452482 27973055 ~ 27989394 (+) True XLOC_003508
TCONS_00006872 mRNA downstream 587059 28107632 ~ 28126139 (+) False XLOC_003509
TCONS_00006853 other upstream 905869 26604611 ~ 26614587 (+) False XLOC_003495
TCONS_00006838 other upstream 1442395 26077947 ~ 26078061 (+) True XLOC_003488
TCONS_00006817 other upstream 2037486 25481107 ~ 25482970 (+) False XLOC_003476
TCONS_00006814 other upstream 2042038 25477743 ~ 25478418 (+) True XLOC_003475
TCONS_00006802 other upstream 2217899 25296376 ~ 25302557 (+) False XLOC_003469
TCONS_00006890 other downstream 1831528 29352101 ~ 29352221 (+) True XLOC_003521
TCONS_00006893 other downstream 2046174 29566747 ~ 29571528 (+) True XLOC_003523
TCONS_00006949 other downstream 3451461 30972034 ~ 30997832 (+) False XLOC_003549
TCONS_00006950 other downstream 3454198 30974771 ~ 30974892 (+) True XLOC_003550
TCONS_00006952 other downstream 3494946 31015519 ~ 31024572 (+) True XLOC_003549