RNA id: TCONS_00072822



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00072822
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_036996
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 12828005 ~ 12828120 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


accacagccatatcaccctgcagcccaagaccggttattctctgaagttaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagatcacatgggaaaactaggttgctgctggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175449

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075073 lncRNA upstream 358962 12461619 ~ 12469043 (+) True XLOC_036995
TCONS_00072807 lncRNA upstream 1889536 10936773 ~ 10938469 (+) True XLOC_036987
TCONS_00075072 lncRNA upstream 2067892 10737086 ~ 10760113 (+) True XLOC_036985
TCONS_00074886 lncRNA upstream 2263059 10562638 ~ 10564946 (+) True XLOC_036982
TCONS_00075071 lncRNA upstream 2670458 10155978 ~ 10157547 (+) True XLOC_036979
TCONS_00072832 lncRNA downstream 115159 12943279 ~ 12943755 (+) False XLOC_037000
TCONS_00072835 lncRNA downstream 248732 13076852 ~ 13089863 (+) True XLOC_037001
TCONS_00072841 lncRNA downstream 405455 13233575 ~ 13234144 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072842 lncRNA downstream 406900 13235020 ~ 13239029 (+) False XLOC_037003
TCONS_00075074 lncRNA downstream 640954 13469074 ~ 13471527 (+) True XLOC_037005
TCONS_00072819 mRNA upstream 372484 12444494 ~ 12455521 (+) False XLOC_036994
TCONS_00072818 mRNA upstream 1232269 11587660 ~ 11595736 (+) True XLOC_036993
TCONS_00072817 mRNA upstream 1232361 11587629 ~ 11595644 (+) False XLOC_036993
TCONS_00072816 mRNA upstream 1293383 11532025 ~ 11534622 (+) True XLOC_036992
TCONS_00072814 mRNA upstream 1418314 11379859 ~ 11409691 (+) True XLOC_036990
TCONS_00072823 mRNA downstream 18920 12847040 ~ 12869049 (+) False XLOC_036997
TCONS_00072824 mRNA downstream 18990 12847110 ~ 12866000 (+) True XLOC_036997
TCONS_00072825 mRNA downstream 59371 12887491 ~ 12894091 (+) False XLOC_036998
TCONS_00072826 mRNA downstream 62041 12890161 ~ 12893808 (+) True XLOC_036998
TCONS_00072827 mRNA downstream 66458 12894578 ~ 12903567 (+) False XLOC_036999
TCONS_00072821 other upstream 373062 12444524 ~ 12454943 (+) True XLOC_036994
TCONS_00072820 other upstream 373247 12444519 ~ 12454758 (+) False XLOC_036994
TCONS_00072815 other upstream 1380096 11447777 ~ 11447909 (+) True XLOC_036991
TCONS_00072801 other upstream 2484025 10343864 ~ 10343980 (+) True XLOC_036980
TCONS_00072788 other upstream 3435774 9371502 ~ 9392231 (+) True XLOC_036971
TCONS_00072843 other downstream 410697 13238817 ~ 13246526 (+) True XLOC_037003
TCONS_00072844 other downstream 620409 13448529 ~ 13448648 (+) True XLOC_037004
TCONS_00072854 other downstream 886291 13714411 ~ 13728936 (+) True XLOC_037008
TCONS_00072861 other downstream 937137 13765257 ~ 13786953 (+) True XLOC_037009
TCONS_00072865 other downstream 1171683 13999803 ~ 14003253 (+) True XLOC_037011

Expression Profile


//