RNA id: TCONS_00072826



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00072826
length 640
RNA type mRNA
GC content 0.48
exon number 5
gene id XLOC_036998
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 12887491 ~ 12894091 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTGGACGGCACCAATCTCAGAGAAGGAGATATTGCTGTGTCTGGAAGGAGTCAGAAGAACTGTTTTGCCAGGAGCTGCCTGTGGACCAAATCTGTGGATGGAAATGTCTACATTGCCTACTCACTCTCTCATGCGTACGACGATGCAGACGTGAAGAACATTAAGGAAGGCATGGAGCTCATCGAACAGGACACTTGTGTGCGCTTCGTGCCCAGAACTCACCAGAGGGACTATCTGGATATTCAGCCCAAAACAGGGTGTTGGTCATATTTGGGGGCACGTGGTGGTAGACAAACCATTTCTCTACAATCGCCCGACTGCACCGGGTCTGGGGTCACTGTGCATGAGCTGATGCATGCTTTGGGCTTTGTGCATGAACAATCCAGAGCCGACCGGGACAAGTATGTGACCATCATGTGGTCTAATATATGGAAAGacAGGCTGAGGAATTTCGAaaagtttaaaacaaacaatttggACACCCCGTACGACTACAGCTCTGTGATGCACTTTGGAAAgTATGCCTTTTCTGAGGATGGAGAACCAACTATTGTGCCGAAAAGGAACTGGAATGTGAAGATTGGACAGAGATTGGGACCCAGCGACTTGGATATAATGAAGATTAATAAACTGTACAGCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000146477

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075073 lncRNA upstream 421118 12461619 ~ 12469043 (+) True XLOC_036995
TCONS_00072807 lncRNA upstream 1951692 10936773 ~ 10938469 (+) True XLOC_036987
TCONS_00075072 lncRNA upstream 2130048 10737086 ~ 10760113 (+) True XLOC_036985
TCONS_00074886 lncRNA upstream 2325215 10562638 ~ 10564946 (+) True XLOC_036982
TCONS_00075071 lncRNA upstream 2732614 10155978 ~ 10157547 (+) True XLOC_036979
TCONS_00072832 lncRNA downstream 49471 12943279 ~ 12943755 (+) False XLOC_037000
TCONS_00072835 lncRNA downstream 183044 13076852 ~ 13089863 (+) True XLOC_037001
TCONS_00072841 lncRNA downstream 339767 13233575 ~ 13234144 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072842 lncRNA downstream 341212 13235020 ~ 13239029 (+) False XLOC_037003
TCONS_00075074 lncRNA downstream 575266 13469074 ~ 13471527 (+) True XLOC_037005
TCONS_00072823 mRNA upstream 21112 12847040 ~ 12869049 (+) False XLOC_036997
TCONS_00072824 mRNA upstream 24161 12847110 ~ 12866000 (+) True XLOC_036997
TCONS_00072819 mRNA upstream 434640 12444494 ~ 12455521 (+) False XLOC_036994
TCONS_00072818 mRNA upstream 1294425 11587660 ~ 11595736 (+) True XLOC_036993
TCONS_00072817 mRNA upstream 1294517 11587629 ~ 11595644 (+) False XLOC_036993
TCONS_00072827 mRNA downstream 770 12894578 ~ 12903567 (+) False XLOC_036999
TCONS_00072828 mRNA downstream 2532 12896340 ~ 12900963 (+) True XLOC_036999
TCONS_00072829 mRNA downstream 11783 12905591 ~ 12915657 (+) False XLOC_037000
TCONS_00072830 mRNA downstream 13766 12907574 ~ 12953824 (+) False XLOC_037000
TCONS_00072831 mRNA downstream 40728 12934536 ~ 12944019 (+) False XLOC_037000
TCONS_00072822 other upstream 62041 12828005 ~ 12828120 (+) True XLOC_036996
TCONS_00072821 other upstream 435218 12444524 ~ 12454943 (+) True XLOC_036994
TCONS_00072820 other upstream 435403 12444519 ~ 12454758 (+) False XLOC_036994
TCONS_00072815 other upstream 1442252 11447777 ~ 11447909 (+) True XLOC_036991
TCONS_00072801 other upstream 2546181 10343864 ~ 10343980 (+) True XLOC_036980
TCONS_00072843 other downstream 345009 13238817 ~ 13246526 (+) True XLOC_037003
TCONS_00072844 other downstream 554721 13448529 ~ 13448648 (+) True XLOC_037004
TCONS_00072854 other downstream 820603 13714411 ~ 13728936 (+) True XLOC_037008
TCONS_00072861 other downstream 871449 13765257 ~ 13786953 (+) True XLOC_037009
TCONS_00072865 other downstream 1105995 13999803 ~ 14003253 (+) True XLOC_037011

Expression Profile


//