RNA id: TCONS_00072844


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00072844
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_037004
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 13448529 ~ 13448648 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTTAACAGTCAACAGCtagctctgcaactctcacatggtcacccgctaaagctaagcagggctgtgcctggtttgtacctggatgggaggccacatgtaaaagctaggttgctgccagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121341

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072842 lncRNA upstream 209500 13235020 ~ 13239029 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072841 lncRNA upstream 214385 13233575 ~ 13234144 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072835 lncRNA upstream 358666 13076852 ~ 13089863 (+) True XLOC_037001
TCONS_00072832 lncRNA upstream 504774 12943279 ~ 12943755 (+) False XLOC_037000
TCONS_00075073 lncRNA upstream 979486 12461619 ~ 12469043 (+) True XLOC_036995
TCONS_00075074 lncRNA downstream 20426 13469074 ~ 13471527 (+) True XLOC_037005
TCONS_00075075 lncRNA downstream 663827 14112475 ~ 14117000 (+) True XLOC_037014
TCONS_00072873 lncRNA downstream 703520 14152168 ~ 14197503 (+) True XLOC_037016
TCONS_00075076 lncRNA downstream 2068885 15517533 ~ 15530690 (+) True XLOC_037018
TCONS_00074887 lncRNA downstream 2078963 15527611 ~ 15529457 (+) True XLOC_037019
TCONS_00072838 mRNA upstream 197202 13229607 ~ 13251327 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072839 mRNA upstream 197498 13230214 ~ 13251031 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072840 mRNA upstream 202310 13230241 ~ 13246219 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072837 mRNA upstream 214657 13229585 ~ 13233872 (+) False XLOC_037003
TCONS_00072836 mRNA upstream 235739 13120419 ~ 13212790 (+) True XLOC_037002
TCONS_00072845 mRNA downstream 179987 13628635 ~ 13672200 (+) False XLOC_037006
TCONS_00072846 mRNA downstream 180007 13628655 ~ 13635451 (+) False XLOC_037006
TCONS_00072847 mRNA downstream 189681 13638329 ~ 13640372 (+) False XLOC_037006
TCONS_00072848 mRNA downstream 193020 13641668 ~ 13672200 (+) True XLOC_037006
TCONS_00072849 mRNA downstream 233485 13682133 ~ 13711991 (+) False XLOC_037007
TCONS_00072843 other upstream 202003 13238817 ~ 13246526 (+) True XLOC_037003
TCONS_00072822 other upstream 620409 12828005 ~ 12828120 (+) True XLOC_036996
TCONS_00072821 other upstream 993586 12444524 ~ 12454943 (+) True XLOC_036994
TCONS_00072820 other upstream 993771 12444519 ~ 12454758 (+) False XLOC_036994
TCONS_00072815 other upstream 2000620 11447777 ~ 11447909 (+) True XLOC_036991
TCONS_00072854 other downstream 265763 13714411 ~ 13728936 (+) True XLOC_037008
TCONS_00072861 other downstream 316609 13765257 ~ 13786953 (+) True XLOC_037009
TCONS_00072865 other downstream 551155 13999803 ~ 14003253 (+) True XLOC_037011
TCONS_00072867 other downstream 562226 14010874 ~ 14014330 (+) True XLOC_037012
TCONS_00072872 other downstream 694425 14143073 ~ 14147153 (+) True XLOC_037015