RNA id: TCONS_00072908



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00072908
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_037044
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 18316403 ~ 18316520 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ttaaacgactatatattatatgcagcccaagaccggttactcactggagctgagcagggctgagcctggtaagtagctggatgggagaccacatgggacaACTGGGTATTTGTtcgaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120459

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072907 lncRNA upstream 67861 18215965 ~ 18248542 (+) True XLOC_037043
TCONS_00074890 lncRNA upstream 679729 17636381 ~ 17636674 (+) True XLOC_037037
TCONS_00072895 lncRNA upstream 876243 17438775 ~ 17440160 (+) True XLOC_037036
TCONS_00074889 lncRNA upstream 972859 17337151 ~ 17343544 (+) True XLOC_037032
TCONS_00072890 lncRNA upstream 981880 17331502 ~ 17334523 (+) True XLOC_037031
TCONS_00072918 lncRNA downstream 595177 18911697 ~ 18914987 (+) False XLOC_037050
TCONS_00075080 lncRNA downstream 595206 18911726 ~ 18914987 (+) True XLOC_037050
TCONS_00072922 lncRNA downstream 778573 19095093 ~ 19101825 (+) False XLOC_037052
TCONS_00074891 lncRNA downstream 912299 19228819 ~ 19229066 (+) True XLOC_037053
TCONS_00075081 lncRNA downstream 932130 19248650 ~ 19249083 (+) False XLOC_037054
TCONS_00072906 mRNA upstream 37823 18215940 ~ 18278580 (+) False XLOC_037043
TCONS_00072904 mRNA upstream 273105 18023288 ~ 18043298 (+) True XLOC_037041
TCONS_00072899 mRNA upstream 309771 17971935 ~ 18006632 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072910 mRNA downstream 256450 18572970 ~ 18587754 (+) False XLOC_037046
TCONS_00072911 mRNA downstream 259527 18576047 ~ 18584555 (+) True XLOC_037046
TCONS_00072916 mRNA downstream 399965 18716485 ~ 18721416 (+) True XLOC_037048
TCONS_00072917 mRNA downstream 512840 18829360 ~ 18905317 (+) True XLOC_037049
TCONS_00072919 mRNA downstream 723088 19039608 ~ 19057957 (+) True XLOC_037051
TCONS_00072905 other upstream 152376 18163629 ~ 18164027 (+) True XLOC_037042
TCONS_00072903 other upstream 317927 17988466 ~ 17998476 (+) True XLOC_037040
TCONS_00072896 other upstream 653338 17662950 ~ 17663065 (+) True XLOC_037038
TCONS_00072889 other upstream 988897 17317167 ~ 17327506 (+) False XLOC_037031
TCONS_00072882 other upstream 2330606 15982344 ~ 15985797 (+) True XLOC_037025
TCONS_00072909 other downstream 33847 18350367 ~ 18350483 (+) True XLOC_037045
TCONS_00072912 other downstream 288940 18605460 ~ 18607993 (+) False XLOC_037047
TCONS_00072913 other downstream 289044 18605564 ~ 18608269 (+) False XLOC_037047
TCONS_00072914 other downstream 289051 18605571 ~ 18607805 (+) False XLOC_037047
TCONS_00072915 other downstream 290217 18606737 ~ 18607988 (+) True XLOC_037047