RNA id: TCONS_00072913



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00072913
length 750
RNA type processed_transcript
GC content 0.42
exon number 4
gene id XLOC_037047
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 18605460 ~ 18608269 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATTGGATCATGGATGCGCTAATGGACGACATGGATGACAAGGCAAGTgcCGTCCTACATGCTCTGGGTGTCTTGAGGAGCTGGTCgttggatgatttttttttttcaggtcttTTTTTCTGGTAAAGATTATCCTTACAGTgaagtaaaataatttaacagaCAGATTGACAAACAACTGACGAAAGAAGAGAGACCATTCAATAGaggacttctagatGTATCCATAATCCTGAAACAGACCGTATCATGAGCAGATGcagtggtggtcatggagaagtggagagcatgagactgattaacGAAAGATCCCAGTGACAGATGAGTgcccgcattgatcctgtggtcCAGCCTGAAAACCCGCTGGtaacctactcacacctgcagcttctccacaatggacgcCCAGTGTTCTtcagcctccagcgcctagactgcggCTCTGCACGTGAAGTGTGGCCAaaagagaaatggttgtgcccaactaagcctagtttctctcaaggtttattcctttactttcatcaattggtaaagttttgttcctccactgtcgccattggcttgcttggtttaggacttgtggaactgtgcatcgatggatttgcttttcagtgtttggactttcagcagtgaaaactaaaccacactgaatttaataaatgttaagctactttgacacaatctacattgtaaaagtactttaaaaaataaagatgaaattaatTGAAATTGTATTGAATATTCAACA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000145678

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072907 lncRNA upstream 357022 18215965 ~ 18248542 (+) True XLOC_037043
TCONS_00074890 lncRNA upstream 968890 17636381 ~ 17636674 (+) True XLOC_037037
TCONS_00072895 lncRNA upstream 1165404 17438775 ~ 17440160 (+) True XLOC_037036
TCONS_00074889 lncRNA upstream 1262020 17337151 ~ 17343544 (+) True XLOC_037032
TCONS_00072890 lncRNA upstream 1271041 17331502 ~ 17334523 (+) True XLOC_037031
TCONS_00072918 lncRNA downstream 303428 18911697 ~ 18914987 (+) False XLOC_037050
TCONS_00075080 lncRNA downstream 303457 18911726 ~ 18914987 (+) True XLOC_037050
TCONS_00072922 lncRNA downstream 486824 19095093 ~ 19101825 (+) False XLOC_037052
TCONS_00074891 lncRNA downstream 620550 19228819 ~ 19229066 (+) True XLOC_037053
TCONS_00075081 lncRNA downstream 640381 19248650 ~ 19249083 (+) False XLOC_037054
TCONS_00072910 mRNA upstream 17810 18572970 ~ 18587754 (+) False XLOC_037046
TCONS_00072911 mRNA upstream 21009 18576047 ~ 18584555 (+) True XLOC_037046
TCONS_00072906 mRNA upstream 326984 18215940 ~ 18278580 (+) False XLOC_037043
TCONS_00072904 mRNA upstream 562266 18023288 ~ 18043298 (+) True XLOC_037041
TCONS_00072901 mRNA upstream 607090 17983463 ~ 17998474 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072916 mRNA downstream 108216 18716485 ~ 18721416 (+) True XLOC_037048
TCONS_00072917 mRNA downstream 221091 18829360 ~ 18905317 (+) True XLOC_037049
TCONS_00072919 mRNA downstream 431339 19039608 ~ 19057957 (+) True XLOC_037051
TCONS_00072920 mRNA downstream 486754 19095023 ~ 19133001 (+) False XLOC_037052
TCONS_00072921 mRNA downstream 486761 19095030 ~ 19119615 (+) False XLOC_037052
TCONS_00072909 other upstream 255081 18350367 ~ 18350483 (+) True XLOC_037045
TCONS_00072908 other upstream 289044 18316403 ~ 18316520 (+) True XLOC_037044
TCONS_00072905 other upstream 441537 18163629 ~ 18164027 (+) True XLOC_037042
TCONS_00072903 other upstream 607088 17988466 ~ 17998476 (+) True XLOC_037040
TCONS_00072896 other upstream 942499 17662950 ~ 17663065 (+) True XLOC_037038
TCONS_00072949 other downstream 1213188 19821457 ~ 19823614 (+) False XLOC_037064
TCONS_00072951 other downstream 1229114 19837383 ~ 19841055 (+) True XLOC_037065
TCONS_00072952 other downstream 1778476 20386745 ~ 20392034 (+) True XLOC_037066
TCONS_00072953 other downstream 1825543 20433812 ~ 20436515 (+) True XLOC_037067
TCONS_00072967 other downstream 2249451 20857720 ~ 20859493 (+) False XLOC_037073

Expression Profile


//