RNA id: TCONS_00073002


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073002
length 716
lncRNA type antisense
GC content 0.49
exon number 2
gene id XLOC_037086
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 21495873 ~ 21496699 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTCCATTCTCAGCctatgacaaacacacacaaagaataCAGGTGGTTGGTCAGAGTGGTTCAGATGCTTCATTGATGACTTTTCTTTTGCCTTTCCCGATGACACAGATGAAGACGAAGACTGTCTCTCTGTAAGCTCATCTGCACTCGGGACCCTACCCAGAAGACAGAGGTCTATCCTCACAACTAGTTTTTTCAGGCCTCGATGAGGGATGGTGGGGGACTTTTCAGTCCGGCCAAAAGGAACGAGTGTATAGAGTTTGTGTCTCCCCCGACTGTGTTTTTCTGTTTCAGGGGTACTTAAGCAGGACCTCTCGGGGTGACTACTTGAGCCTGAATTTTGTTTCTCATGCCTGCTCTTTgatacagtttttttgtttgatgTTGAATCTGCAGGGACTTTCGCAATGTTCCTGGGTGGACTAGACTCAGAGTCTGATTCAGAGGAAGATGATGAGGATGAAAAGGAAGATGAGGATGAAGAAGATAATGGATGGGTGGGCTTGACGACAGGAGTAGGGGTAGGTGGAGAGAGTGGAGGAGAAGGGCTAGAGTCTGTCACATAAGGACGTGAGGAAACGTCTCCGTTACTCCACCGTCTCTTCTTCCTCCTCTGCTCCTCAAGGTTGGGTCCATTGCATTCCCTTTGTGTGTGATGCTGGCTTGTGTGAGGTCTTTGTTTGGGCTGAACTGCCCTCCATTCAGCTTCCGGTTCCC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000154531

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072993 lncRNA upstream 139054 21353068 ~ 21356819 (+) True XLOC_037082
TCONS_00075091 lncRNA upstream 290401 21202272 ~ 21205472 (+) False XLOC_037077
TCONS_00075092 lncRNA upstream 290401 21202948 ~ 21205472 (+) False XLOC_037077
TCONS_00075090 lncRNA upstream 624816 20863668 ~ 20871057 (+) False XLOC_037073
TCONS_00072969 lncRNA upstream 624816 20867269 ~ 20871057 (+) False XLOC_037073
TCONS_00073006 lncRNA downstream 61260 21557959 ~ 21558801 (+) False XLOC_037087
TCONS_00075093 lncRNA downstream 73224 21569923 ~ 21712146 (+) False XLOC_037087
TCONS_00075094 lncRNA downstream 73842 21570541 ~ 21601633 (+) False XLOC_037087
TCONS_00075095 lncRNA downstream 73842 21570541 ~ 21755910 (+) False XLOC_037087
TCONS_00075096 lncRNA downstream 74650 21571349 ~ 21712146 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073001 mRNA upstream 86407 21407987 ~ 21409466 (+) True XLOC_037085
TCONS_00072999 mRNA upstream 90807 21401189 ~ 21405066 (+) False XLOC_037084
TCONS_00073000 mRNA upstream 92117 21402863 ~ 21403756 (+) True XLOC_037084
TCONS_00072998 mRNA upstream 94571 21383738 ~ 21401302 (+) False XLOC_037084
TCONS_00072997 mRNA upstream 96218 21383627 ~ 21399655 (+) False XLOC_037084
TCONS_00073003 mRNA downstream 39186 21535885 ~ 21566673 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073004 mRNA downstream 39423 21536122 ~ 21570566 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073008 mRNA downstream 226034 21722733 ~ 21724661 (+) True XLOC_037088
TCONS_00073009 mRNA downstream 296866 21793565 ~ 21816606 (+) False XLOC_037090
TCONS_00073010 mRNA downstream 299218 21795917 ~ 21816234 (+) False XLOC_037090
TCONS_00072979 other upstream 269741 21214940 ~ 21226132 (+) True XLOC_037078
TCONS_00072978 other upstream 291151 21204616 ~ 21204722 (+) True XLOC_037077
TCONS_00072967 other upstream 636380 20857720 ~ 20859493 (+) False XLOC_037073
TCONS_00072953 other upstream 1059358 20433812 ~ 20436515 (+) True XLOC_037067
TCONS_00072952 other upstream 1103839 20386745 ~ 20392034 (+) True XLOC_037066
TCONS_00073005 other downstream 44154 21540853 ~ 21559785 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073007 other downstream 74734 21571433 ~ 21712146 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073020 other downstream 487410 21984109 ~ 21985996 (+) True XLOC_037095
TCONS_00073021 other downstream 493359 21990058 ~ 21991212 (+) False XLOC_037096
TCONS_00073026 other downstream 496429 21993128 ~ 21993915 (+) False XLOC_037097

Expression Profile

//