RNA id: TCONS_00073391



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073391
length 894
lncRNA type lincRNA
GC content 0.48
exon number 3
gene id XLOC_037294
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 34822849 ~ 34828098 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGAAACCTCTGGAGCGCCTTGATGCGGCGTACAGTTTACCTACAGGCAGGGCTTTGTCTCTGCCAGCCTCTTCCCTGTGAGCGGATGAGAGCTGCATGACTACCGTAACACACATCCAGCCCTCGTACAGCAGCAGGAGACGGAGCTCACAGCGGGATTCCCCAAATCCCTGGCCTTCCTTGCTCGACCATGTCCACAAATGAAAGGGAAGAGGACCACACAGGAACCAACGACGACGCCGTGTCACTGTTCAAAACAGACACCCCTGTAAACACAACACATGCTTCACATGGGCTGATCGTTGCAGTTTCACGCTTATCAAAAATAAGCATCGGGCTGGATGCACCTCTCGCCGCTACCTTCGCAGAATCTCAAGTATCTTATGCAAACTGTGTGCGTTTGTTGGGGAGCTCTGGCAGCGACTGATGAGTGTCTCATTATCTCCACACCAGCCGTACACAGTAAGAAGAGCATAATCAAAGCCTGGGGGATATTTCAATTTGATGCTCAACAAGCTGAGCCTGAGATTAAAGGATCATACGTGTCATCCACACAAACATCACTTCCAGAGCAGGCGAGCGTACGTGAGCTCAGCTTTTCCAAGAGAGAGGCGTCACCGCCGCAGACGACGCAGTCGCACTTCTgtctccctgtgtgtgtgtgtgtgtgcaactgAAGGCTGATGCGATGCTTCTCACATGTTTGAGATGTCGAGGAAGGAGTCTTTCCTttttttacatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacgtgtgacGAATTTtgcttttaagaaatatttatgaGCCGGTAcccttcttaaaaaaaaaaaaaaaggaaaaaaagaaagcgTTGTCTTTAATGAACATGTTTTAGAGATTGTTTCAGCATCTAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000194075

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073382 lncRNA upstream 403296 34416401 ~ 34419553 (+) False XLOC_037290
TCONS_00075165 lncRNA upstream 431696 34390451 ~ 34391153 (+) True XLOC_037289
TCONS_00074930 lncRNA upstream 445046 34375528 ~ 34377803 (+) True XLOC_037287
TCONS_00074927 lncRNA upstream 446439 34372848 ~ 34376410 (+) False XLOC_037287
TCONS_00073393 lncRNA downstream 122844 34950942 ~ 34959774 (+) False XLOC_037295
TCONS_00075166 lncRNA downstream 142745 34970843 ~ 34973324 (+) True XLOC_037297
TCONS_00073399 lncRNA downstream 177993 35006091 ~ 35010396 (+) True XLOC_037298
TCONS_00073406 lncRNA downstream 198206 35026304 ~ 35030107 (+) True XLOC_037299
TCONS_00075167 lncRNA downstream 249452 35077550 ~ 35081996 (+) False XLOC_037300
TCONS_00073389 mRNA upstream 175154 34641237 ~ 34647695 (+) True XLOC_037292
TCONS_00073387 mRNA upstream 340151 34433053 ~ 34482698 (+) False XLOC_037291
TCONS_00073388 mRNA upstream 345296 34434943 ~ 34477553 (+) True XLOC_037291
TCONS_00073384 mRNA upstream 393274 34425736 ~ 34429575 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073380 mRNA upstream 394697 34397516 ~ 34428152 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073394 mRNA downstream 122844 34950942 ~ 34968429 (+) False XLOC_037295
TCONS_00073395 mRNA downstream 124105 34952203 ~ 34962725 (+) False XLOC_037295
TCONS_00073396 mRNA downstream 124171 34952269 ~ 34962969 (+) True XLOC_037295
TCONS_00073398 mRNA downstream 168147 34996245 ~ 35009747 (+) False XLOC_037298
TCONS_00073400 mRNA downstream 186415 35014513 ~ 35025517 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073390 other upstream 31962 34790750 ~ 34790887 (+) True XLOC_037293
TCONS_00073386 other upstream 393629 34426291 ~ 34429220 (+) True XLOC_037290
TCONS_00073385 other upstream 393729 34425775 ~ 34429120 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073383 other upstream 393737 34425728 ~ 34429112 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073362 other upstream 986379 33810446 ~ 33836470 (+) True XLOC_037278
TCONS_00073397 other downstream 141352 34969450 ~ 34969567 (+) True XLOC_037296
TCONS_00073405 other downstream 189749 35017847 ~ 35022314 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073409 other downstream 601104 35429202 ~ 35429316 (+) True XLOC_037302
TCONS_00073415 other downstream 1033986 35862084 ~ 35863842 (+) True XLOC_037304
TCONS_00073420 other downstream 1966286 36794384 ~ 36795322 (+) False XLOC_037311

Expression Profile


//