RNA id: TCONS_00073409


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073409
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_037302
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 35429202 ~ 35429316 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

cctggcagctagctctctgcaactctcaaatggttgcccactgaagctaagctggGCTGCGCAAAGCCAGTAACTGGATGGGtgaccacttgggaaagctaggttgatgCCGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181826

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075169 lncRNA upstream 261268 35160698 ~ 35167934 (+) True XLOC_037301
TCONS_00075168 lncRNA upstream 265538 35160644 ~ 35163664 (+) False XLOC_037301
TCONS_00075167 lncRNA upstream 347206 35077550 ~ 35081996 (+) False XLOC_037300
TCONS_00073408 lncRNA upstream 347972 35079570 ~ 35081230 (+) True XLOC_037300
TCONS_00073406 lncRNA upstream 399095 35026304 ~ 35030107 (+) True XLOC_037299
TCONS_00073414 lncRNA downstream 431756 35861072 ~ 35862896 (+) False XLOC_037304
TCONS_00075170 lncRNA downstream 558528 35987844 ~ 36102672 (+) True XLOC_037307
TCONS_00075171 lncRNA downstream 695437 36124753 ~ 36177421 (+) True XLOC_037308
TCONS_00075172 lncRNA downstream 1341348 36770664 ~ 36775514 (+) True XLOC_037310
TCONS_00075173 lncRNA downstream 1498739 36928055 ~ 36930192 (+) False XLOC_037312
TCONS_00073407 mRNA upstream 347221 35077546 ~ 35081981 (+) False XLOC_037300
TCONS_00073404 mRNA upstream 402594 35017702 ~ 35026608 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073400 mRNA upstream 403685 35014513 ~ 35025517 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073401 mRNA upstream 403685 35014728 ~ 35025517 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073403 mRNA upstream 404085 35016201 ~ 35025117 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073410 mRNA downstream 402978 35832294 ~ 35842375 (+) False XLOC_037303
TCONS_00073411 mRNA downstream 403054 35832370 ~ 35836174 (+) True XLOC_037303
TCONS_00073412 mRNA downstream 414416 35843732 ~ 35865528 (+) False XLOC_037304
TCONS_00073413 mRNA downstream 431659 35860975 ~ 35863572 (+) False XLOC_037304
TCONS_00073416 mRNA downstream 447611 35876927 ~ 35885260 (+) True XLOC_037305
TCONS_00073405 other upstream 406888 35017847 ~ 35022314 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073397 other upstream 459635 34969450 ~ 34969567 (+) True XLOC_037296
TCONS_00073390 other upstream 638315 34790750 ~ 34790887 (+) True XLOC_037293
TCONS_00073386 other upstream 999982 34426291 ~ 34429220 (+) True XLOC_037290
TCONS_00073385 other upstream 1000082 34425775 ~ 34429120 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073415 other downstream 432768 35862084 ~ 35863842 (+) True XLOC_037304
TCONS_00073420 other downstream 1365068 36794384 ~ 36795322 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073421 other downstream 1365403 36794719 ~ 36797775 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073422 other downstream 1365403 36794719 ~ 36797828 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073423 other downstream 1365403 36794719 ~ 36797834 (+) True XLOC_037311