RNA id: TCONS_00073423



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073423
length 980
RNA type processed_transcript
GC content 0.33
exon number 4
gene id XLOC_037311
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 36794384 ~ 36797834 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


cacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaaggtaagctctggtcttcatgtggtcattatgactaagttatcattatggttaaatttgtaaactgtaagttagttattcaCTAAACTCACTAATGAAACAAgtctaactgttttattaaattgagctgataataaaattcagtttatgtcttttaagctaacgttaatattaacataattcatattaattgtctatttctcactggttaatgagcttattgtataacgttagtgtgtcattaattgtacattttatttttggtgttcaggtgtagggaatgatttgtatacaaatttatttgaaccccatacagatttgtatggttgtaccatagatttagattattaaatgttaagtattattttactcttattatatttatcttttttgcagccacagcaattgatgttgaaaaagtgatgctaccaatctctcctctcttgattattcaagctcagattgtgatagacctggaatgtgacaccagatactcttaagtcaagaaccaaataaagcacagatgtggagggatctgcaactaaactaactggaggaaaggaacctttagtgtgggtgaacatactaccttgatgtccagcaaaggctgcacaagagctcatttgatggcacatattctgtcctgtctacatctctgacgacctggaagtgcttcgacattagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtcccttttccacaacatcatttgaccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaatactttttgatgcatttattgttgactggttttaatgatcaattgttcattagtgttctgttgctttgttatattgaataattgctactgtttcagtagggtttacacaataaacttttattgtgaagttaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000148340

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075172 lncRNA upstream 19205 36770664 ~ 36775514 (+) True XLOC_037310
TCONS_00075171 lncRNA upstream 617298 36124753 ~ 36177421 (+) True XLOC_037308
TCONS_00075170 lncRNA upstream 692047 35987844 ~ 36102672 (+) True XLOC_037307
TCONS_00073414 lncRNA upstream 931823 35861072 ~ 35862896 (+) False XLOC_037304
TCONS_00075169 lncRNA upstream 1626785 35160698 ~ 35167934 (+) True XLOC_037301
TCONS_00075173 lncRNA downstream 130221 36928055 ~ 36930192 (+) False XLOC_037312
TCONS_00075174 lncRNA downstream 130221 36928055 ~ 36932532 (+) True XLOC_037312
TCONS_00075175 lncRNA downstream 193329 36991163 ~ 36991851 (+) True XLOC_037315
TCONS_00075176 lncRNA downstream 677313 37475147 ~ 37492914 (+) True XLOC_037321
TCONS_00075177 lncRNA downstream 709125 37506959 ~ 37508273 (+) True XLOC_037322
TCONS_00073418 mRNA upstream 99721 36314867 ~ 36694998 (+) False XLOC_037309
TCONS_00073419 mRNA upstream 99721 36356740 ~ 36694998 (+) True XLOC_037309
TCONS_00073417 mRNA upstream 872518 35901554 ~ 35922201 (+) True XLOC_037306
TCONS_00073416 mRNA upstream 909459 35876927 ~ 35885260 (+) True XLOC_037305
TCONS_00073413 mRNA upstream 931147 35860975 ~ 35863572 (+) False XLOC_037304
TCONS_00073424 mRNA downstream 148506 36946340 ~ 36956667 (+) True XLOC_037313
TCONS_00073425 mRNA downstream 169460 36967294 ~ 36974879 (+) True XLOC_037314
TCONS_00073426 mRNA downstream 344002 37141836 ~ 37296908 (+) False XLOC_037316
TCONS_00073427 mRNA downstream 354730 37152564 ~ 37297485 (+) True XLOC_037316
TCONS_00073429 mRNA downstream 522388 37320222 ~ 37339656 (+) False XLOC_037318
TCONS_00073415 other upstream 930877 35862084 ~ 35863842 (+) True XLOC_037304
TCONS_00073409 other upstream 1365403 35429202 ~ 35429316 (+) True XLOC_037302
TCONS_00073405 other upstream 1772405 35017847 ~ 35022314 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073397 other upstream 1825152 34969450 ~ 34969567 (+) True XLOC_037296
TCONS_00073390 other upstream 2003832 34790750 ~ 34790887 (+) True XLOC_037293
TCONS_00073428 other downstream 383606 37181440 ~ 37181557 (+) True XLOC_037317
TCONS_00073432 other downstream 614036 37411870 ~ 37411986 (+) True XLOC_037320
TCONS_00073437 other downstream 1079600 37877434 ~ 37877550 (+) True XLOC_037325
TCONS_00073445 other downstream 1360964 38158798 ~ 38161649 (+) True XLOC_037329
TCONS_00073446 other downstream 1362612 38160446 ~ 38160572 (+) True XLOC_037330

Expression Profile


//