RNA id: TCONS_00073432



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073432
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_037320
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 37411870 ~ 37411986 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCTACAGCCATATcgccctgcagcccaagactggttactgaCTAAATCTTAGAAGGGCTGAgattggtcagtacctggatggaagaccacatgagaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190013

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075175 lncRNA upstream 420019 36991163 ~ 36991851 (+) True XLOC_037315
TCONS_00075174 lncRNA upstream 479338 36928055 ~ 36932532 (+) True XLOC_037312
TCONS_00075173 lncRNA upstream 481678 36928055 ~ 36930192 (+) False XLOC_037312
TCONS_00075172 lncRNA upstream 636356 36770664 ~ 36775514 (+) True XLOC_037310
TCONS_00075171 lncRNA upstream 1234449 36124753 ~ 36177421 (+) True XLOC_037308
TCONS_00075176 lncRNA downstream 63161 37475147 ~ 37492914 (+) True XLOC_037321
TCONS_00075177 lncRNA downstream 94973 37506959 ~ 37508273 (+) True XLOC_037322
TCONS_00075178 lncRNA downstream 609904 38021890 ~ 38024061 (+) True XLOC_037326
TCONS_00073443 lncRNA downstream 746614 38158600 ~ 38161207 (+) False XLOC_037329
TCONS_00073452 lncRNA downstream 880933 38292919 ~ 38296930 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073429 mRNA upstream 72214 37320222 ~ 37339656 (+) False XLOC_037318
TCONS_00073430 mRNA upstream 77256 37329036 ~ 37334614 (+) True XLOC_037318
TCONS_00073427 mRNA upstream 114385 37152564 ~ 37297485 (+) True XLOC_037316
TCONS_00073426 mRNA upstream 114962 37141836 ~ 37296908 (+) False XLOC_037316
TCONS_00073425 mRNA upstream 436991 36967294 ~ 36974879 (+) True XLOC_037314
TCONS_00073433 mRNA downstream 342859 37754845 ~ 37840350 (+) True XLOC_037323
TCONS_00073434 mRNA downstream 438374 37850360 ~ 37862563 (+) False XLOC_037324
TCONS_00073435 mRNA downstream 438438 37850424 ~ 37860493 (+) False XLOC_037324
TCONS_00073436 mRNA downstream 438460 37850446 ~ 37856907 (+) True XLOC_037324
TCONS_00073438 mRNA downstream 631351 38043337 ~ 38065147 (+) True XLOC_037327
TCONS_00073428 other upstream 230313 37181440 ~ 37181557 (+) True XLOC_037317
TCONS_00073423 other upstream 614036 36794719 ~ 36797834 (+) True XLOC_037311
TCONS_00073422 other upstream 614042 36794719 ~ 36797828 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073421 other upstream 614095 36794719 ~ 36797775 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073420 other upstream 616548 36794384 ~ 36795322 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073437 other downstream 465448 37877434 ~ 37877550 (+) True XLOC_037325
TCONS_00073445 other downstream 746812 38158798 ~ 38161649 (+) True XLOC_037329
TCONS_00073446 other downstream 748460 38160446 ~ 38160572 (+) True XLOC_037330
TCONS_00073447 other downstream 749277 38161263 ~ 38161389 (+) True XLOC_037331
TCONS_00073451 other downstream 867397 38279383 ~ 38286788 (+) True XLOC_037332