RNA id: TCONS_00073447


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073447
length 127
RNA type snoRNA
GC content 0.36
exon number 1
gene id XLOC_037331
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 38161263 ~ 38161389 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATATACTGAAAATTATTTCAGTTGTAACCATCAACTGGAGTAAGATAACTGTGCCGACAGAAAATGGTACATTTTAAGCTTATTGTCTGTCACTTTGACACGCAATGAAACCCATGTGCCAACAGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119285

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073443 lncRNA upstream 56 38158600 ~ 38161207 (+) False XLOC_037329
TCONS_00075178 lncRNA upstream 137202 38021890 ~ 38024061 (+) True XLOC_037326
TCONS_00075177 lncRNA upstream 652990 37506959 ~ 37508273 (+) True XLOC_037322
TCONS_00075176 lncRNA upstream 668349 37475147 ~ 37492914 (+) True XLOC_037321
TCONS_00075175 lncRNA upstream 1169412 36991163 ~ 36991851 (+) True XLOC_037315
TCONS_00073452 lncRNA downstream 131530 38292919 ~ 38296930 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073455 lncRNA downstream 146297 38307686 ~ 38308570 (+) True XLOC_037333
TCONS_00073462 lncRNA downstream 251359 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073463 lncRNA downstream 258623 38420012 ~ 38421036 (+) False XLOC_037338
TCONS_00073469 lncRNA downstream 308652 38470041 ~ 38470807 (+) False XLOC_037341
TCONS_00073444 mRNA upstream 197 38158603 ~ 38161066 (+) False XLOC_037329
TCONS_00073439 mRNA upstream 31178 38074082 ~ 38130085 (+) False XLOC_037328
TCONS_00073441 mRNA upstream 31904 38088331 ~ 38129359 (+) True XLOC_037328
TCONS_00073440 mRNA upstream 31918 38075851 ~ 38129345 (+) False XLOC_037328
TCONS_00073438 mRNA upstream 96116 38043337 ~ 38065147 (+) True XLOC_037327
TCONS_00073448 mRNA downstream 2487 38163876 ~ 38291809 (+) False XLOC_037332
TCONS_00073449 mRNA downstream 6623 38168012 ~ 38289987 (+) False XLOC_037332
TCONS_00073450 mRNA downstream 111844 38273233 ~ 38276461 (+) False XLOC_037332
TCONS_00073454 mRNA downstream 131558 38292947 ~ 38311750 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073456 mRNA downstream 153077 38314466 ~ 38352220 (+) True XLOC_037334
TCONS_00073446 other upstream 691 38160446 ~ 38160572 (+) True XLOC_037330
TCONS_00073437 other upstream 283713 37877434 ~ 37877550 (+) True XLOC_037325
TCONS_00073432 other upstream 749277 37411870 ~ 37411986 (+) True XLOC_037320
TCONS_00073428 other upstream 979706 37181440 ~ 37181557 (+) True XLOC_037317
TCONS_00073423 other upstream 1363429 36794719 ~ 36797834 (+) True XLOC_037311
TCONS_00073451 other downstream 117994 38279383 ~ 38286788 (+) True XLOC_037332
TCONS_00073453 other downstream 131558 38292947 ~ 38311747 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073484 other downstream 523482 38684871 ~ 38707510 (+) False XLOC_037347
TCONS_00073487 other downstream 576223 38737612 ~ 38744774 (+) False XLOC_037348
TCONS_00073489 other downstream 625539 38786928 ~ 38787044 (+) True XLOC_037349

Expression Profile

//