RNA id: TCONS_00073489



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073489
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_037349
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 38786928 ~ 38787044 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgccacagccatgtcaccctgcagcccaaaacCAGTtgctcactaaagctaagcagggctgagtctggtcaTTAACTGGATAGTAGACCACATTGGAaggctaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183489

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073476 lncRNA upstream 168597 38615603 ~ 38618331 (+) True XLOC_037344
TCONS_00073469 lncRNA upstream 316121 38470041 ~ 38470807 (+) False XLOC_037341
TCONS_00073463 lncRNA upstream 365892 38420012 ~ 38421036 (+) False XLOC_037338
TCONS_00073462 lncRNA upstream 368817 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073455 lncRNA upstream 478358 38307686 ~ 38308570 (+) True XLOC_037333
TCONS_00074931 lncRNA downstream 1076209 39863253 ~ 39865672 (+) True XLOC_037353
TCONS_00073518 lncRNA downstream 2293050 41080094 ~ 41083181 (+) False XLOC_037363
TCONS_00073517 lncRNA downstream 2293050 41080094 ~ 41083181 (+) True XLOC_037363
TCONS_00073527 lncRNA downstream 2451197 41238241 ~ 41240872 (+) False XLOC_037366
TCONS_00075179 lncRNA downstream 2451197 41238241 ~ 41246508 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073486 mRNA upstream 12525 38712474 ~ 38774403 (+) False XLOC_037348
TCONS_00073488 mRNA upstream 15201 38737924 ~ 38771727 (+) True XLOC_037348
TCONS_00073485 mRNA upstream 79418 38684871 ~ 38707510 (+) False XLOC_037347
TCONS_00073483 mRNA upstream 79418 38684871 ~ 38707510 (+) True XLOC_037347
TCONS_00073481 mRNA upstream 104691 38644976 ~ 38682237 (+) False XLOC_037346
TCONS_00073490 mRNA downstream 96344 38883388 ~ 38959196 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073491 mRNA downstream 100981 38888025 ~ 38967999 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073492 mRNA downstream 174973 38962017 ~ 38993033 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073493 mRNA downstream 175354 38962398 ~ 38989473 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073494 mRNA downstream 180204 38967248 ~ 38991000 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073487 other upstream 42154 38737612 ~ 38744774 (+) False XLOC_037348
TCONS_00073484 other upstream 79418 38684871 ~ 38707510 (+) False XLOC_037347
TCONS_00073453 other upstream 475181 38292947 ~ 38311747 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073451 other upstream 500140 38279383 ~ 38286788 (+) True XLOC_037332
TCONS_00073447 other upstream 625539 38161263 ~ 38161389 (+) True XLOC_037331
TCONS_00073497 other downstream 223388 39010432 ~ 39011384 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073498 other downstream 223401 39010445 ~ 39014598 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073499 other downstream 224182 39011226 ~ 39013435 (+) True XLOC_037351
TCONS_00073504 other downstream 1350453 40137497 ~ 40137612 (+) True XLOC_037354
TCONS_00073505 other downstream 1491103 40278147 ~ 40278263 (+) True XLOC_037355

Expression Profile


//