RNA id: TCONS_00073498


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073498
length 621
RNA type processed_transcript
GC content 0.38
exon number 6
gene id XLOC_037351
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 39010432 ~ 39014598 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aatttgaaatccacctgtcgccttttcctccagtgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaagctacagcaattgatgttgaaaaactgatgctaccaatctctcctcacttgattattcaagctcagattgtgatgaacctggaatgcgacaccagttactcttaagtcaagaaccaaataaagcacagatgtggagggatctacaactaaactaactggaggaaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaagactgcacaagagctcatttaaTGGcacattctgtcctgtctacatctctgacaaCCTgaaagtgcttcgacatcagatcatcagaagtgctcctgccctttttcactgtcccttttctacaacatcatttggccttcatcatttcgtgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaatactttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaatttttcattagtgttctgttgctgtgttatattgaataattgctactgtttcagtatggtttacacaataaacttttatt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000132438

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073476 lncRNA upstream 392114 38615603 ~ 38618331 (+) True XLOC_037344
TCONS_00073469 lncRNA upstream 539638 38470041 ~ 38470807 (+) False XLOC_037341
TCONS_00073463 lncRNA upstream 589409 38420012 ~ 38421036 (+) False XLOC_037338
TCONS_00073462 lncRNA upstream 592334 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073455 lncRNA upstream 701875 38307686 ~ 38308570 (+) True XLOC_037333
TCONS_00074931 lncRNA downstream 848655 39863253 ~ 39865672 (+) True XLOC_037353
TCONS_00073518 lncRNA downstream 2065496 41080094 ~ 41083181 (+) False XLOC_037363
TCONS_00073517 lncRNA downstream 2065496 41080094 ~ 41083181 (+) True XLOC_037363
TCONS_00073527 lncRNA downstream 2223643 41238241 ~ 41240872 (+) False XLOC_037366
TCONS_00075179 lncRNA downstream 2223643 41238241 ~ 41246508 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073492 mRNA upstream 17412 38962017 ~ 38993033 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073496 mRNA upstream 19079 38983895 ~ 38991366 (+) True XLOC_037350
TCONS_00073494 mRNA upstream 19445 38967248 ~ 38991000 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073493 mRNA upstream 20972 38962398 ~ 38989473 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073495 mRNA upstream 35417 38967998 ~ 38975028 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073500 mRNA downstream 11713 39026311 ~ 39139722 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073501 mRNA downstream 12525 39027123 ~ 39136765 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073502 mRNA downstream 12714 39027312 ~ 39136845 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073503 mRNA downstream 12714 39027312 ~ 39138504 (+) True XLOC_037352
TCONS_00073506 mRNA downstream 1532079 40546677 ~ 40617382 (+) True XLOC_037356
TCONS_00073489 other upstream 223401 38786928 ~ 38787044 (+) True XLOC_037349
TCONS_00073487 other upstream 265671 38737612 ~ 38744774 (+) False XLOC_037348
TCONS_00073484 other upstream 302935 38684871 ~ 38707510 (+) False XLOC_037347
TCONS_00073453 other upstream 698698 38292947 ~ 38311747 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073451 other upstream 723657 38279383 ~ 38286788 (+) True XLOC_037332
TCONS_00073504 other downstream 1122899 40137497 ~ 40137612 (+) True XLOC_037354
TCONS_00073505 other downstream 1263549 40278147 ~ 40278263 (+) True XLOC_037355
TCONS_00073509 other downstream 1881051 40895649 ~ 40896812 (+) False XLOC_037359
TCONS_00073510 other downstream 1881173 40895771 ~ 40897183 (+) True XLOC_037359
TCONS_00073529 other downstream 2234859 41249457 ~ 41266843 (+) True XLOC_037367

Expression Profile

//