RNA id: TCONS_00073504


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073504
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_037354
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 40137497 ~ 40137612 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGTCACAGCTCTATCACCCTGTAGCCCAATACGGTCACTCACTGAAGCTATGCAGGGCTGCATCTGGTCAGTACctgtatgggagaccacatgagaaaactaggttgcagttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176476

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074931 lncRNA upstream 271825 39863253 ~ 39865672 (+) True XLOC_037353
TCONS_00073476 lncRNA upstream 1519166 38615603 ~ 38618331 (+) True XLOC_037344
TCONS_00073469 lncRNA upstream 1666690 38470041 ~ 38470807 (+) False XLOC_037341
TCONS_00073463 lncRNA upstream 1716461 38420012 ~ 38421036 (+) False XLOC_037338
TCONS_00073462 lncRNA upstream 1719386 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073518 lncRNA downstream 942482 41080094 ~ 41083181 (+) False XLOC_037363
TCONS_00073517 lncRNA downstream 942482 41080094 ~ 41083181 (+) True XLOC_037363
TCONS_00073527 lncRNA downstream 1100629 41238241 ~ 41240872 (+) False XLOC_037366
TCONS_00075179 lncRNA downstream 1100629 41238241 ~ 41246508 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073528 lncRNA downstream 1103156 41240768 ~ 41246508 (+) True XLOC_037366
TCONS_00073500 mRNA upstream 997775 39026311 ~ 39139722 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073503 mRNA upstream 998993 39027312 ~ 39138504 (+) True XLOC_037352
TCONS_00073502 mRNA upstream 1000652 39027312 ~ 39136845 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073501 mRNA upstream 1000732 39027123 ~ 39136765 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073492 mRNA upstream 1144464 38962017 ~ 38993033 (+) False XLOC_037350
TCONS_00073506 mRNA downstream 409065 40546677 ~ 40617382 (+) True XLOC_037356
TCONS_00073507 mRNA downstream 687453 40825065 ~ 40825989 (+) True XLOC_037357
TCONS_00073508 mRNA downstream 736582 40874194 ~ 40924943 (+) True XLOC_037358
TCONS_00073511 mRNA downstream 801724 40939336 ~ 40943137 (+) True XLOC_037360
TCONS_00073512 mRNA downstream 887361 41024973 ~ 41034174 (+) False XLOC_037361
TCONS_00073498 other upstream 1122899 39010445 ~ 39014598 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073499 other upstream 1124062 39011226 ~ 39013435 (+) True XLOC_037351
TCONS_00073497 other upstream 1126113 39010432 ~ 39011384 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073489 other upstream 1350453 38786928 ~ 38787044 (+) True XLOC_037349
TCONS_00073487 other upstream 1392723 38737612 ~ 38744774 (+) False XLOC_037348
TCONS_00073505 other downstream 140535 40278147 ~ 40278263 (+) True XLOC_037355
TCONS_00073509 other downstream 758037 40895649 ~ 40896812 (+) False XLOC_037359
TCONS_00073510 other downstream 758159 40895771 ~ 40897183 (+) True XLOC_037359
TCONS_00073529 other downstream 1111845 41249457 ~ 41266843 (+) True XLOC_037367
TCONS_00073536 other downstream 1455884 41593496 ~ 41593610 (+) True XLOC_037370