RNA id: TCONS_00073505


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073505
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_037355
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 40278147 ~ 40278263 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atatacagccatattaccctgcagcccaagaccggttactccctgaagccaagcagggctgagcctggttagtacctggatgggagaccactagggaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176761

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074931 lncRNA upstream 412475 39863253 ~ 39865672 (+) True XLOC_037353
TCONS_00073476 lncRNA upstream 1659816 38615603 ~ 38618331 (+) True XLOC_037344
TCONS_00073469 lncRNA upstream 1807340 38470041 ~ 38470807 (+) False XLOC_037341
TCONS_00073463 lncRNA upstream 1857111 38420012 ~ 38421036 (+) False XLOC_037338
TCONS_00073462 lncRNA upstream 1860036 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073518 lncRNA downstream 801831 41080094 ~ 41083181 (+) False XLOC_037363
TCONS_00073517 lncRNA downstream 801831 41080094 ~ 41083181 (+) True XLOC_037363
TCONS_00073527 lncRNA downstream 959978 41238241 ~ 41240872 (+) False XLOC_037366
TCONS_00075179 lncRNA downstream 959978 41238241 ~ 41246508 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073528 lncRNA downstream 962505 41240768 ~ 41246508 (+) True XLOC_037366
TCONS_00073500 mRNA upstream 1138425 39026311 ~ 39139722 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073503 mRNA upstream 1139643 39027312 ~ 39138504 (+) True XLOC_037352
TCONS_00073502 mRNA upstream 1141302 39027312 ~ 39136845 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073501 mRNA upstream 1141382 39027123 ~ 39136765 (+) False XLOC_037352
TCONS_00073496 mRNA upstream 1286781 38983895 ~ 38991366 (+) True XLOC_037350
TCONS_00073506 mRNA downstream 268414 40546677 ~ 40617382 (+) True XLOC_037356
TCONS_00073507 mRNA downstream 546802 40825065 ~ 40825989 (+) True XLOC_037357
TCONS_00073508 mRNA downstream 595931 40874194 ~ 40924943 (+) True XLOC_037358
TCONS_00073511 mRNA downstream 661073 40939336 ~ 40943137 (+) True XLOC_037360
TCONS_00073512 mRNA downstream 746710 41024973 ~ 41034174 (+) False XLOC_037361
TCONS_00073504 other upstream 140535 40137497 ~ 40137612 (+) True XLOC_037354
TCONS_00073498 other upstream 1263549 39010445 ~ 39014598 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073499 other upstream 1264712 39011226 ~ 39013435 (+) True XLOC_037351
TCONS_00073497 other upstream 1266763 39010432 ~ 39011384 (+) False XLOC_037351
TCONS_00073489 other upstream 1491103 38786928 ~ 38787044 (+) True XLOC_037349
TCONS_00073509 other downstream 617386 40895649 ~ 40896812 (+) False XLOC_037359
TCONS_00073510 other downstream 617508 40895771 ~ 40897183 (+) True XLOC_037359
TCONS_00073529 other downstream 971194 41249457 ~ 41266843 (+) True XLOC_037367
TCONS_00073536 other downstream 1315233 41593496 ~ 41593610 (+) True XLOC_037370
TCONS_00073538 other downstream 1404663 41682926 ~ 41683010 (+) True XLOC_037372

Expression Profile

//