RNA id: TCONS_00073538


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073538
length 85
RNA type miRNA
GC content 0.36
exon number 1
gene id XLOC_037372
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 41682926 ~ 41683010 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGATAAAGTTCCACCGAGGGTTAAATGTTTTGGTATTTTAATAGTGTCAATCTCAAAGCAGAGAACTCTCGGTGGAGATGTATTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118033

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073535 lncRNA upstream 84099 41509948 ~ 41598827 (+) True XLOC_037369
TCONS_00073534 lncRNA upstream 103924 41509948 ~ 41579002 (+) False XLOC_037369
TCONS_00073533 lncRNA upstream 203540 41474942 ~ 41479386 (+) True XLOC_037368
TCONS_00075179 lncRNA upstream 436418 41238241 ~ 41246508 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073528 lncRNA upstream 436418 41240768 ~ 41246508 (+) True XLOC_037366
TCONS_00073541 lncRNA downstream 105207 41788217 ~ 41806355 (+) True XLOC_037375
TCONS_00075180 lncRNA downstream 419191 42102201 ~ 42108086 (+) True XLOC_037379
TCONS_00074932 lncRNA downstream 475366 42158376 ~ 42158616 (+) True XLOC_037381
TCONS_00075181 lncRNA downstream 665948 42348958 ~ 42500284 (+) False XLOC_037383
TCONS_00075182 lncRNA downstream 775089 42458099 ~ 42500284 (+) False XLOC_037383
TCONS_00073537 mRNA upstream 1873 41612642 ~ 41681053 (+) True XLOC_037371
TCONS_00073532 mRNA upstream 201276 41474623 ~ 41481650 (+) False XLOC_037368
TCONS_00073531 mRNA upstream 203404 41459772 ~ 41479522 (+) False XLOC_037368
TCONS_00073530 mRNA upstream 212518 41459759 ~ 41470408 (+) False XLOC_037368
TCONS_00073525 mRNA upstream 435737 41218974 ~ 41247189 (+) False XLOC_037366
TCONS_00073539 mRNA downstream 7143 41690153 ~ 41741420 (+) True XLOC_037373
TCONS_00073542 mRNA downstream 138603 41821613 ~ 41979505 (+) False XLOC_037376
TCONS_00073544 mRNA downstream 231368 41914378 ~ 41979505 (+) False XLOC_037376
TCONS_00073543 mRNA downstream 231368 41914378 ~ 41979505 (+) True XLOC_037376
TCONS_00073547 mRNA downstream 380896 42063906 ~ 42125329 (+) False XLOC_037378
TCONS_00073536 other upstream 89316 41593496 ~ 41593610 (+) True XLOC_037370
TCONS_00073529 other upstream 416083 41249457 ~ 41266843 (+) True XLOC_037367
TCONS_00073510 other upstream 785743 40895771 ~ 40897183 (+) True XLOC_037359
TCONS_00073509 other upstream 786114 40895649 ~ 40896812 (+) False XLOC_037359
TCONS_00073505 other upstream 1404663 40278147 ~ 40278263 (+) True XLOC_037355
TCONS_00073540 other downstream 50523 41733533 ~ 41733610 (+) True XLOC_037374
TCONS_00073545 other downstream 307076 41990086 ~ 42038319 (+) True XLOC_037377
TCONS_00073546 other downstream 357547 42040557 ~ 42095177 (+) False XLOC_037378
TCONS_00073552 other downstream 416727 42099737 ~ 42125384 (+) True XLOC_037378
TCONS_00073560 other downstream 1648385 43331395 ~ 43331511 (+) True XLOC_037386