RNA id: TCONS_00075188



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00075188
length 10650
lncRNA type read_through
GC content 0.41
exon number 3
gene id XLOC_037385
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 42732199 ~ 42905622 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTATAGTGCTGAAAACATGCTTTATTAAATCAGTCATTCATAAAACTCAAGGAGGCTGAATATATGGGTAATACTACATAAATTAATTCTAATCAATCAATGTGCAGGGTATTACATTCATGTATCTCTCTTTTCTTTGCACAGCACATGAAGTCTACTATActagcacacacaaaaacacacacaatagaaTCTAACAATCCTCCAAGAGCTGGCACAGTTTCTGCAAATGAGTACTTGAATTGAGTTTACAATTAATGGCCAGGTGATGGTAGTTTTGTAAAAGCTAAATTCAAACAGTCTTTCGACAGAAACAGTGCACATACATTATTATGAACTCAGTGTGCAGGCCGCTCGCACCTTGAGCATGTCATTAAAATGGTGGTATGACATAGTCAGTCTGAACACAAGGCCTAGTTGCCCAGCTTACATGAGGGTAAATGCAAACAGCGCTCAGGGCCTTACATTCAAGTAACAATGCATAAGAGTATGGTTGTAATATCGCTGCACATGTAAACATGCAGGTATAACTTAGTCTCTCAGAGTTAAAGTAACGTCAACAGGGAGCCTCTCTACCTGTTGAGGCAATCTTAAAGACTTCAACTTATTGTTGAGGCACAGAGTTTAGTTTCAGATTCATCAGGGTATTCGTTCCATGTGAAACTTTCTCCTGATAAATATTTAGTTCCTTTTGTTTCAgttaatattgttataaataacAATTCATACATTTTCCATAACCGTTAACTTCGGCTATATACATTATGTACACGTCACAGAAAAATGGATCAAAAATCCTAAGTCATAATTATCCAATATGGCACATTTTATAATAACTTTAGACTTTAGTCTAGTTTGGCATAAATTAATGTCAAGTTTGGTATAAAAATAGTTTATATTTACAGGAACAGATATCCAGGTACGTATCAAgattttcttttctctctctcatttaataaaaacaaagttgCTTAACGTAGGAAGGGGTGGGGTATAAATTATGGCTTTACTTTGATCGAATACTGATGGTAACAGTTGCCAAGTCAGATCCATGCTCATTAGAAAGTTTGAGTGTGTATGCCCCAGCATCGGTCTCTTTCACACCAGTGATAATGAGTGTGGTGAGGTCCTCGGTTGTCTCAATATGGAACCTACTGCTATCTTCTTCTCCAGGCAGTTTCTTTCCACCTCGAGACCACTCAATATGAGGTGCTGGTTCTCCGGAGAAGGCACAAGCCACGGTAAGAACCTTTCCAGTTTCAACGCTGATATCTTCAGGAAGAGCTTCAATTCTCGGAGCTAAgcctataaaatataaattagttTGAAATGATAATAAGCCATCATGTAATAATTGTGCATATTTGTTTAGAGTCAAATTGGTTCTTACCTTGAGCACTGTGAAGGGCTGCTCTGACTGAAGTTTCTTCAGCATGTGAATGACTTGACATTATACTGCTTGAGCTCATTGCATACACTGACTCTGATGTCATGGATGACATGCTAGACATTGACATAGTTTCAAATTTCATCTCAGCCATTGCTGAACTGCTGAATGATGCCTCTTGCATTGTGCTCTCCATGTGGATGGATTTTGAGGTAAAACTTTCATGCATGCTGCTAACTGCAGCACTTTCCCTCTTAATAACCATTTCACTTCCTCCTTGGATTTTGGAAGACACGGattctggaagaaaaaatatttaaagtactgACATTAAGAAGAGCAGAAAACAAAAGGAAAACTAATCTAATTTAGGTCAGATAAAACGTTACCTTGAACAGCCTTATGTGCAGCGACGAATGCAGTAACTTTTGTGTAAATTGCTTGAAACACTTGCCCAACAAAAGAGAATGATGTTCTTGACACTGCTCCTCCCTCACTTATGATTTCACATGAATATTCACCTTGATCGTCCTCTGAAACATCGGATATATAGAGACAGCAAGTTCCATCTGCAGATGAATGAATCTGGTAGTGACTGCTTTGGCTTAGTTTTCTGCTGTCTTTGTACCACACAACTTCTCTCAGTGAGCTCTCAGCAACAAAGATCATCCTAATTTTGTCTTCAAAAGCCTCAGCTTTGAGTTGCTGAATGATCTTTGGTGGTGCTTCCTTTGATGGGGTTGGGGACTTCACTGTAAGTGGTGATTTCATTCTTTTAGGTGACATAATTGGTTCAGGAGATTTGACTGTTGGTGGGGATTTGGCTCTTTGAGGTTCAGGAGACTTAAGTCCTGTAGGGGATTTTACTCTCAGAGGCGAAGCAATTGGCTCAGGAGACTTAATAGGAGGAGGAGATTTTACCCTGGGAGGTGAAGCTATTGGAGACTTCACTCCTTGAGGTGTGGTTGGTTCTGGAGATTTAAGAGGAGGTGGAGATTTAACTCTCTGAAGAGAGGTGGCTGGCTCTGGTGATTTTACTCTGAATGGTGACTTGATGCCCTCTGGAGATTTAATTCGAGGTTCAGGAGACTTAATGCCAGTGGGTTCTGGTGATTTAATTTGGGGTTCTGGAGACTTTACGGAAGGCACAGGGGATTTGACTGAAGGCTCTGGAGATTTCAGTGATGGTACAGGGGATTTTACCAAAGGTTCTGGAGACTTTACCGATGGCACTGGAGATTTCACAGAGGGCTCTGGGGACTTTACAGATGGCACTGGAGAAGTAACTGATGACTCTGGAGATTTAATTGGTGGCACCGGAGATGCCACTGAGGGCTCTGGTGACTTCACTTGTGTTGGTGTTACTTCCTCTTTAAGTATTGGTTTATTAATAGCCAAGGTACATCTTGCCTCTTGCTTTCCTTCTGAATTTTCCACAACTACAGTATAGTTGCCCTCATCTGAATATTCAACTGATGAAATTTCCAAAGTAGACTTATACTGTGTGGTAGACACATGAATACGATGTGAAGAGACAACTGTTCTTCCCTCATGCATCCATGTGACAGTTGGTGCTGGCTCTCCATCAATATCACACACGAATCGTGCAGAGTCACCCTCAGACACAATCAGAGAATGTGGTTTTGTGAGTATTTTGGCTGAAAGGGTAGCTTTAATTTTCTTTACCGATACTTCAGCAGATGTTTCTGATTCTTTTAACTTTGATTCAGATGACACATGCTTTTCTGATGTTGTATGTCTCTCAGAGGATGAATATGAAGCTGATGATAGGTATTCAGTTGATGCATATCTAATTGGAGATGATGCAAGCCTCTGAGATTCATACTTTTCAAAGGAAGAAACTTCATGTCTCTCGGTTAACTTTGTTTTGAATTCTTGAATCTCCAAGTGAGTTCTTGAGGCAGAGGAAGCTCTGATTGTTGTTGAATGATAATAATCTGTTTTTGTTATATCAGGTACAATTTGTGTCGGGGCCTCCTCATCTCGACGTCTTGAAGAGTATGTAGTAAATGCTCCACCTGAAACATCAAGAGTTGCATAGTCTGATGCCTCACCCTTTGAATTTGTGCAAAGAGCACGGTATGTGCCAGTGTCCTCAGCCTGACAGTCATTAATCTGGAGAGATAGGACTCCACTCATATTTGTAAACTGGTATTTGTGGCTCTCTTGTATTTGTTGTCCATTGTGGAACCACTGGATATTGGCATCAGGCTTGGACTGAACATTCAAAGTGAATTTAGTGTTTTGACCACATGGTACACGGTGAGAGCGCATTCTTACAGTGATACGTGGAGCATGGTCAAGACTGAATGGTTGCTGTGTTACAACCTGGTATTTGCGCTCAGATTTAAGAGCAGCTTTCCTTGCTTCATATCTAGACATGATGTCAAATCTTGCAGACCTTTCAAATCTAGAAGAGGATCTGGAGGATCTTCTTTCTGGGGATACAGGACTTGGTGATCGAGGACGAGTTCTCTCAGGGGTGGGTGATCTTCTTTCAATTATTTCAACTTCAGCCTCTGTTGGGATGCGTGCACGAGGTTGCCTGATGAGTTCAGAGACAGGGCGCATCAGTTCAATGTATGTTGGAGACAAGGATCTTCTCCTTCTCAAGAAATGTGATATAGGAGGAGGAGAGCCTCGAGCTTGCTCCGTTGTTACATGTTTTGTCTCTTCTACACGTCTCACTTCAGCTCTGTGAACAGGTCTTGGTGAGGCACGTCGCAGTGCAGACAACTCAAAGCGCACAGGGCTTCCACTAGGTGGGGAGGCAGAGAAGCCCAGTTCTAGTTCTTCTTCAAGCTCTCGTCTTTCTTTTTCTGATAATTTTGTTGCCAGATACTCCTCTTCCTTAAGCAGCTCCTCATCTGAAATATCACCAAGTGAGCGTCTTCTCAGTCTGAATGATGCCTCTGATTCAGGGGATGGTGAACGCCTGGCTGGTCGAACAGTCTCCAAATCATCTTGTGTAAGTTTTGGAATGCGCCATTTCGGTCTGTACTGATCAGTTATTCTAGGCAGTGGCATAACATAAAATTGCTCCCATCTGGAAAGACGAATCCGCCTTTGTCTCTTCTGAACTATTCTTTCCATTCTCTCAGGAATTTCATACTGGTCACGCAACTTTTTATACCATTTCATGTCAGATAGGGGCACAAAGTGTTTAATCATTTTATCTTCATCAAGAACTGTTGGATCATGTGCACGGGCTTCAGGGATTTCATAAGGCATACGTATCTTCTTCTCTTCCTCtataattttctttatttcttgaTCCTCTTTATCAGAGATATCAAACTCACCCTGCACATGCTTGGTGCTAACTGCCGGTTTATATAATTCCGCAGCTTCTTTCAAAGCCTCTTGTGCTACAGGATTGAGTGCAACAACTTCAGCTTTTGAGAACTCTTGTGCCATTTTCAGTGTCTTTTCTATTTGGTTTCTTACATATATATGTCTTTCTTCCTCGCTCTTGAACTCCCTCCTTGTGTATGTTAGTCGTTCAACTTTGAGAGTAGCTTGACAGCTTGCTGATCCAGCTGTATTTGTTGCAGTGACTCTGTATGTTCCTGAATCCTCTATGAGAGTTTCT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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00073568 mRNA downstream 1129175 44034797 ~ 44088067 (+) False XLOC_037390
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TCONS_00073552 other upstream 607608 42099737 ~ 42125384 (+) True XLOC_037378
TCONS_00073546 other upstream 637815 42040557 ~ 42095177 (+) False XLOC_037378
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Expression Profile


//