RNA id: TCONS_00073561


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073561
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_037387
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 43775251 ~ 43775365 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCGGTAGCGAGCTCTCTGCAACTGTCACATGGCCGCCCTGtaaagccaagcagggctgcgcctggtcagtacctagatgggagaccacatgggaaagctaggttactgccggag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184166

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075186 lncRNA upstream 869629 42732199 ~ 42905622 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075188 lncRNA upstream 869629 42732992 ~ 42905622 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075187 lncRNA upstream 873714 42732991 ~ 42901537 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075189 lncRNA upstream 873714 42894843 ~ 42901537 (+) True XLOC_037385
TCONS_00075184 lncRNA upstream 1274967 42491425 ~ 42500284 (+) False XLOC_037383
TCONS_00073563 lncRNA downstream 22778 43798143 ~ 43801464 (+) False XLOC_037388
TCONS_00073565 lncRNA downstream 25511 43800876 ~ 43879792 (+) True XLOC_037388
TCONS_00073574 lncRNA downstream 655607 44430972 ~ 44469429 (+) False XLOC_037393
TCONS_00075190 lncRNA downstream 679778 44455143 ~ 44456108 (+) True XLOC_037394
TCONS_00073584 lncRNA downstream 1220282 44995647 ~ 44998575 (+) False XLOC_037398
TCONS_00073556 mRNA upstream 1124628 42546504 ~ 42650623 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073557 mRNA upstream 1124628 42606681 ~ 42650623 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073559 mRNA upstream 1125072 42607146 ~ 42650179 (+) True XLOC_037384
TCONS_00073558 mRNA upstream 1125653 42607138 ~ 42649598 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073555 mRNA upstream 1504291 42270043 ~ 42270960 (+) True XLOC_037382
TCONS_00073562 mRNA downstream 22537 43797902 ~ 43880326 (+) False XLOC_037388
TCONS_00073564 mRNA downstream 24464 43799829 ~ 43883267 (+) False XLOC_037388
TCONS_00073567 mRNA downstream 259425 44034790 ~ 44088067 (+) False XLOC_037390
TCONS_00073568 mRNA downstream 259432 44034797 ~ 44088067 (+) False XLOC_037390
TCONS_00073569 mRNA downstream 259625 44034990 ~ 44080500 (+) True XLOC_037390
TCONS_00073560 other upstream 443740 43331395 ~ 43331511 (+) True XLOC_037386
TCONS_00073552 other upstream 1649867 42099737 ~ 42125384 (+) True XLOC_037378
TCONS_00073546 other upstream 1680074 42040557 ~ 42095177 (+) False XLOC_037378
TCONS_00073545 other upstream 1736932 41990086 ~ 42038319 (+) True XLOC_037377
TCONS_00073540 other upstream 2041641 41733533 ~ 41733610 (+) True XLOC_037374
TCONS_00073566 other downstream 80130 43855495 ~ 43855610 (+) True XLOC_037389
TCONS_00073582 other downstream 1156810 44932175 ~ 44932293 (+) True XLOC_037397
TCONS_00073585 other downstream 1220904 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073586 other downstream 1288790 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073589 other downstream 1451736 45227101 ~ 45334105 (+) False XLOC_037402