RNA id: TCONS_00073566



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073566
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_037389
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 43855495 ~ 43855610 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTGAAGGCCATATCAACCTGCAGCCCAATaatggttactcactgaagcaaagcagggctgagcctgttcagtacctggatgggagaccacatggaaaaactagcaatcaacctgc

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176953

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073563 lncRNA upstream 54031 43798143 ~ 43801464 (+) False XLOC_037388
TCONS_00075186 lncRNA upstream 949873 42732199 ~ 42905622 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075188 lncRNA upstream 949873 42732992 ~ 42905622 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075187 lncRNA upstream 953958 42732991 ~ 42901537 (+) False XLOC_037385
TCONS_00075189 lncRNA upstream 953958 42894843 ~ 42901537 (+) True XLOC_037385
TCONS_00073574 lncRNA downstream 575362 44430972 ~ 44469429 (+) False XLOC_037393
TCONS_00075190 lncRNA downstream 599533 44455143 ~ 44456108 (+) True XLOC_037394
TCONS_00073584 lncRNA downstream 1140037 44995647 ~ 44998575 (+) False XLOC_037398
TCONS_00075191 lncRNA downstream 1184155 45039765 ~ 45044991 (+) True XLOC_037399
TCONS_00075192 lncRNA downstream 1256886 45112496 ~ 45116841 (+) False XLOC_037401
TCONS_00073556 mRNA upstream 1204872 42546504 ~ 42650623 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073557 mRNA upstream 1204872 42606681 ~ 42650623 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073559 mRNA upstream 1205316 42607146 ~ 42650179 (+) True XLOC_037384
TCONS_00073558 mRNA upstream 1205897 42607138 ~ 42649598 (+) False XLOC_037384
TCONS_00073555 mRNA upstream 1584535 42270043 ~ 42270960 (+) True XLOC_037382
TCONS_00073567 mRNA downstream 179180 44034790 ~ 44088067 (+) False XLOC_037390
TCONS_00073568 mRNA downstream 179187 44034797 ~ 44088067 (+) False XLOC_037390
TCONS_00073569 mRNA downstream 179380 44034990 ~ 44080500 (+) True XLOC_037390
TCONS_00073570 mRNA downstream 449370 44304980 ~ 44369857 (+) True XLOC_037391
TCONS_00073571 mRNA downstream 535644 44391254 ~ 44420380 (+) False XLOC_037392
TCONS_00073561 other upstream 80130 43775251 ~ 43775365 (+) True XLOC_037387
TCONS_00073560 other upstream 523984 43331395 ~ 43331511 (+) True XLOC_037386
TCONS_00073552 other upstream 1730111 42099737 ~ 42125384 (+) True XLOC_037378
TCONS_00073546 other upstream 1760318 42040557 ~ 42095177 (+) False XLOC_037378
TCONS_00073545 other upstream 1817176 41990086 ~ 42038319 (+) True XLOC_037377
TCONS_00073582 other downstream 1076565 44932175 ~ 44932293 (+) True XLOC_037397
TCONS_00073585 other downstream 1140659 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073586 other downstream 1208545 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073589 other downstream 1371491 45227101 ~ 45334105 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073592 other downstream 1684867 45540477 ~ 45540593 (+) True XLOC_037402