RNA id: TCONS_00073582


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073582
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_037397
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 44932175 ~ 44932293 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaccacagccatgtcaccctgtagcccaagactggttactcactgaggttaagcagggctgagtctggttagtacctggatgggagaccacatgggaaaactataggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118010

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073574 lncRNA upstream 462746 44430972 ~ 44469429 (+) False XLOC_037393
TCONS_00075190 lncRNA upstream 476067 44455143 ~ 44456108 (+) True XLOC_037394
TCONS_00073565 lncRNA upstream 1052383 43800876 ~ 43879792 (+) True XLOC_037388
TCONS_00073563 lncRNA upstream 1130711 43798143 ~ 43801464 (+) False XLOC_037388
TCONS_00075186 lncRNA upstream 2026553 42732199 ~ 42905622 (+) False XLOC_037385
TCONS_00073584 lncRNA downstream 63354 44995647 ~ 44998575 (+) False XLOC_037398
TCONS_00075191 lncRNA downstream 107472 45039765 ~ 45044991 (+) True XLOC_037399
TCONS_00075192 lncRNA downstream 180203 45112496 ~ 45116841 (+) False XLOC_037401
TCONS_00074933 lncRNA downstream 329091 45261384 ~ 45261761 (+) True XLOC_037403
TCONS_00074934 lncRNA downstream 616494 45548787 ~ 45553378 (+) False XLOC_037404
TCONS_00073581 mRNA upstream 93027 44832032 ~ 44839148 (+) True XLOC_037396
TCONS_00073578 mRNA upstream 106756 44722205 ~ 44825419 (+) False XLOC_037395
TCONS_00073580 mRNA upstream 106830 44722267 ~ 44825345 (+) True XLOC_037395
TCONS_00073577 mRNA upstream 107675 44721808 ~ 44824500 (+) False XLOC_037395
TCONS_00073579 mRNA upstream 175013 44722236 ~ 44757162 (+) False XLOC_037395
TCONS_00073583 mRNA downstream 61921 44994214 ~ 44998722 (+) False XLOC_037398
TCONS_00073587 mRNA downstream 180244 45112537 ~ 45122990 (+) True XLOC_037401
TCONS_00073588 mRNA downstream 294735 45227028 ~ 45540996 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073590 mRNA downstream 495748 45428041 ~ 45540996 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073591 mRNA downstream 561048 45493341 ~ 45541367 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073566 other upstream 1076565 43855495 ~ 43855610 (+) True XLOC_037389
TCONS_00073561 other upstream 1156810 43775251 ~ 43775365 (+) True XLOC_037387
TCONS_00073560 other upstream 1600664 43331395 ~ 43331511 (+) True XLOC_037386
TCONS_00073552 other upstream 2806791 42099737 ~ 42125384 (+) True XLOC_037378
TCONS_00073546 other upstream 2836998 42040557 ~ 42095177 (+) False XLOC_037378
TCONS_00073585 other downstream 63976 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073586 other downstream 131862 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073589 other downstream 294808 45227101 ~ 45334105 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073592 other downstream 608184 45540477 ~ 45540593 (+) True XLOC_037402
TCONS_00073600 other downstream 889176 45821469 ~ 45821585 (+) True XLOC_037408