RNA id: TCONS_00074933


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00074933
length 274
lncRNA type intronic
GC content 0.48
exon number 2
gene id XLOC_037403
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 45261384 ~ 45261761 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GACACTCTTTTGTGCTCCGTAAAGCTCTGGCGCTTTGACCATCCCGTTTGTCAACAGGGTCCCATTTCAGTGAGTGCACTCGGATTTTGTACATGGTCCGATAATGAAACCGGAAGACCAAAACAATGTCAAGTGCAATGAGATTTCGTCAGCATGTTTTTGCTCTCTCCGTCTCTAGAGGAGCACTCGCTCAGCGGGGGGAGTGTGATGCAGCACTGTTTTCTAGTTCATGTCAATCACTGCCATGTGCTCAGTTTTCTGTGGATATTTTGCC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075192 lncRNA upstream 144543 45112496 ~ 45116841 (+) False XLOC_037401
TCONS_00075191 lncRNA upstream 216393 45039765 ~ 45044991 (+) True XLOC_037399
TCONS_00073584 lncRNA upstream 262809 44995647 ~ 44998575 (+) False XLOC_037398
TCONS_00073574 lncRNA upstream 791955 44430972 ~ 44469429 (+) False XLOC_037393
TCONS_00075190 lncRNA upstream 805276 44455143 ~ 44456108 (+) True XLOC_037394
TCONS_00074934 lncRNA downstream 287026 45548787 ~ 45553378 (+) False XLOC_037404
TCONS_00073593 lncRNA downstream 289307 45551068 ~ 45553378 (+) True XLOC_037404
TCONS_00075193 lncRNA downstream 603506 45865267 ~ 45879991 (+) False XLOC_037410
TCONS_00074935 lncRNA downstream 603630 45865391 ~ 45868067 (+) False XLOC_037410
TCONS_00075194 lncRNA downstream 616898 45878659 ~ 45884134 (+) True XLOC_037410
TCONS_00073587 mRNA upstream 138394 45112537 ~ 45122990 (+) True XLOC_037401
TCONS_00073583 mRNA upstream 262662 44994214 ~ 44998722 (+) False XLOC_037398
TCONS_00073581 mRNA upstream 422236 44832032 ~ 44839148 (+) True XLOC_037396
TCONS_00073578 mRNA upstream 435965 44722205 ~ 44825419 (+) False XLOC_037395
TCONS_00073590 mRNA downstream 166280 45428041 ~ 45540996 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073591 mRNA downstream 231580 45493341 ~ 45541367 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073594 mRNA downstream 343649 45605410 ~ 45623647 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073595 mRNA downstream 343656 45605417 ~ 45667487 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073597 mRNA downstream 343779 45605540 ~ 45667259 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073586 other upstream 197115 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073585 other upstream 263961 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073582 other upstream 329091 44932175 ~ 44932293 (+) True XLOC_037397
TCONS_00073566 other upstream 1405774 43855495 ~ 43855610 (+) True XLOC_037389
TCONS_00073561 other upstream 1486019 43775251 ~ 43775365 (+) True XLOC_037387
TCONS_00073592 other downstream 278716 45540477 ~ 45540593 (+) True XLOC_037402
TCONS_00073600 other downstream 559708 45821469 ~ 45821585 (+) True XLOC_037408
TCONS_00073602 other downstream 1159266 46421027 ~ 46431133 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073638 other downstream 4523559 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435
TCONS_00073648 other downstream 4827239 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440

Expression Profile

//