RNA id: TCONS_00073599



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073599
length 488
RNA type mRNA
GC content 0.55
exon number 2
gene id XLOC_037407
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 45789887 ~ 45794194 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CCAGCTTTCCCCCTGGTCCTCTTACGGGTGCCAGTCGGTGTTTCCCGAGGCTCAGCTGACCTTCACGGATTTAGACTCGCAGTCTCCGCAGCTGGAGGTCGGTGCTGAAGTGGACAGCTCCTTACTGGACGAGCCCCATGAGATGACCCAGCAGCAGCAGCGGTGCTTGGCGACGCATCATCCGTACAAGGTGCAGCGCCACGCCGCCAACATCCGTGAGAGGAAGAGGATGCTGAGCATTAATTCTGCGTTTGAGGAGCTGCGCTGCCACGTGCCCACCTTCCCCTACGAGAAAAGGTTGTCCAAAATAGACACGCTAAGACTGGCCATCGCTTACATCGCCCTGCTCAGGGAAATCCTCCTATCAGGCTGTGACCCCAAATCATATGTGGACGAATGCATGAAGAACGGCTATAAGAATCAGACAAATGCCATCTGGAACACAAGCGATCTGACAGCTCGGCTCTCTTGGATAAAGTGGGATTAGC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000135202

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074934 lncRNA upstream 236509 45548787 ~ 45553378 (+) False XLOC_037404
TCONS_00073593 lncRNA upstream 236509 45551068 ~ 45553378 (+) True XLOC_037404
TCONS_00074933 lncRNA upstream 528126 45261384 ~ 45261761 (+) True XLOC_037403
TCONS_00075192 lncRNA upstream 673046 45112496 ~ 45116841 (+) False XLOC_037401
TCONS_00075191 lncRNA upstream 744896 45039765 ~ 45044991 (+) True XLOC_037399
TCONS_00075193 lncRNA downstream 71073 45865267 ~ 45879991 (+) False XLOC_037410
TCONS_00074935 lncRNA downstream 71197 45865391 ~ 45868067 (+) False XLOC_037410
TCONS_00075194 lncRNA downstream 84465 45878659 ~ 45884134 (+) True XLOC_037410
TCONS_00075195 lncRNA downstream 584515 46378709 ~ 46395404 (+) True XLOC_037411
TCONS_00075196 lncRNA downstream 620964 46415158 ~ 46431296 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073598 mRNA upstream 92243 45680802 ~ 45697644 (+) True XLOC_037406
TCONS_00073595 mRNA upstream 122400 45605417 ~ 45667487 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073597 mRNA upstream 122628 45605540 ~ 45667259 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073596 mRNA upstream 122628 45605540 ~ 45667259 (+) True XLOC_037405
TCONS_00073594 mRNA upstream 166240 45605410 ~ 45623647 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073601 mRNA downstream 45066 45839260 ~ 45843479 (+) True XLOC_037409
TCONS_00073604 mRNA downstream 850439 46644633 ~ 46684539 (+) True XLOC_037414
TCONS_00073605 mRNA downstream 951154 46745348 ~ 46799620 (+) True XLOC_037415
TCONS_00073606 mRNA downstream 2167288 47961482 ~ 47970760 (+) False XLOC_037418
TCONS_00073607 mRNA downstream 2167529 47961723 ~ 47967510 (+) False XLOC_037418
TCONS_00073592 other upstream 249294 45540477 ~ 45540593 (+) True XLOC_037402
TCONS_00073589 other upstream 455782 45227101 ~ 45334105 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073586 other upstream 725618 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073585 other upstream 792464 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073582 other upstream 857594 44932175 ~ 44932293 (+) True XLOC_037397
TCONS_00073600 other downstream 27275 45821469 ~ 45821585 (+) True XLOC_037408
TCONS_00073602 other downstream 626833 46421027 ~ 46431133 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073638 other downstream 3991126 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435
TCONS_00073648 other downstream 4294806 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440
TCONS_00073655 other downstream 5006163 50800357 ~ 50800473 (+) True XLOC_037446

Expression Profile


//