RNA id: TCONS_00073600


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073600
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_037408
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 45821469 ~ 45821585 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTCTACAGCCAAATCACCCTCCAGCTCAAGAGCGGTAACTCACTGAAGATAAGCAGGTCTGAGTCTGATTAGTATctgcatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgtttgaA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185460

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074934 lncRNA upstream 268091 45548787 ~ 45553378 (+) False XLOC_037404
TCONS_00073593 lncRNA upstream 268091 45551068 ~ 45553378 (+) True XLOC_037404
TCONS_00074933 lncRNA upstream 559708 45261384 ~ 45261761 (+) True XLOC_037403
TCONS_00075192 lncRNA upstream 704628 45112496 ~ 45116841 (+) False XLOC_037401
TCONS_00075191 lncRNA upstream 776478 45039765 ~ 45044991 (+) True XLOC_037399
TCONS_00075193 lncRNA downstream 43682 45865267 ~ 45879991 (+) False XLOC_037410
TCONS_00074935 lncRNA downstream 43806 45865391 ~ 45868067 (+) False XLOC_037410
TCONS_00075194 lncRNA downstream 57074 45878659 ~ 45884134 (+) True XLOC_037410
TCONS_00075195 lncRNA downstream 557124 46378709 ~ 46395404 (+) True XLOC_037411
TCONS_00075196 lncRNA downstream 593573 46415158 ~ 46431296 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073599 mRNA upstream 27275 45789887 ~ 45794194 (+) True XLOC_037407
TCONS_00073598 mRNA upstream 123825 45680802 ~ 45697644 (+) True XLOC_037406
TCONS_00073595 mRNA upstream 153982 45605417 ~ 45667487 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073597 mRNA upstream 154210 45605540 ~ 45667259 (+) False XLOC_037405
TCONS_00073596 mRNA upstream 154210 45605540 ~ 45667259 (+) True XLOC_037405
TCONS_00073601 mRNA downstream 17675 45839260 ~ 45843479 (+) True XLOC_037409
TCONS_00073604 mRNA downstream 823048 46644633 ~ 46684539 (+) True XLOC_037414
TCONS_00073605 mRNA downstream 923763 46745348 ~ 46799620 (+) True XLOC_037415
TCONS_00073606 mRNA downstream 2139897 47961482 ~ 47970760 (+) False XLOC_037418
TCONS_00073607 mRNA downstream 2140138 47961723 ~ 47967510 (+) False XLOC_037418
TCONS_00073592 other upstream 280876 45540477 ~ 45540593 (+) True XLOC_037402
TCONS_00073589 other upstream 487364 45227101 ~ 45334105 (+) False XLOC_037402
TCONS_00073586 other upstream 757200 45064155 ~ 45064269 (+) True XLOC_037400
TCONS_00073585 other upstream 824046 44996269 ~ 44997423 (+) True XLOC_037398
TCONS_00073582 other upstream 889176 44932175 ~ 44932293 (+) True XLOC_037397
TCONS_00073602 other downstream 599442 46421027 ~ 46431133 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073638 other downstream 3963735 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435
TCONS_00073648 other downstream 4267415 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440
TCONS_00073655 other downstream 4978772 50800357 ~ 50800473 (+) True XLOC_037446
TCONS_00073665 other downstream 6260726 52082311 ~ 52082437 (+) True XLOC_037460