RNA id: TCONS_00073656



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073656
length 708
lncRNA type lincRNA
GC content 0.56
exon number 3
gene id XLOC_037448
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 51043455 ~ 51060961 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AAATTGAACAAGAGCCTCAGAATTCTAATCCTGTGTCTGTCTTGTTTTGTAGGGTCATTTTTCCAGTGCAACACTCACATCATCCCGGTGAAGAACGAAGAGGGAGTGGTGATGATGTTCATCCTGAATTTTGATTACGTGTTGGACGAGGACAGCAGCAGCTCTACGGAGAGACTGAACCTCACGCcgcccgccaaagctgaaatcaGAAAAGGCCGGTTCTTCCGTCTGCGTCTGCCCTCACTGAAGCTCCTGGGGGTCAGTAAACAGTCTCTCCCTCAGGACGACCCAGACTCAGTCATGGTGGACTCACCCAGAGCCAGCGACCAGAGTGATGACTCTGCGGCAGTGATGGATGTCCCGTCGCCTACCCAGCATGTCTGCAGTCCAGCCGATGCCAACGACACGCGGGCGCTGATCCGCTCCAGCAGCCAATCATCTCCGGTCAGCGTTCCTCTGGACCACTCATCCCCCAGACAGACGTGGCATCGGCCCGGAGCAGCTCAGACTCAGTCCAGCAGCTGTCTGGCGCAGGCCGTGTCCAGAGACAGTGTGTGCAGCCGCAGACGAGCCTCCTCCGTCCACGACATCGAAGGGTTGAGCGCAAACCACAAACGCCtctacacagacagacacaccaGTGAAGGTGAGTGAGCCATCAcaacataggtctcaaacttgatgCCTGGAGGGCTGCAACTATGCACA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000194974

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074939 lncRNA upstream 102602 50940357 ~ 50940853 (+) True XLOC_037447
TCONS_00075218 lncRNA upstream 339598 50702484 ~ 50703857 (+) False XLOC_037445
TCONS_00075219 lncRNA upstream 339598 50702513 ~ 50703857 (+) False XLOC_037445
TCONS_00075220 lncRNA upstream 339598 50702581 ~ 50703857 (+) True XLOC_037445
TCONS_00074938 lncRNA upstream 557948 50362528 ~ 50485507 (+) False XLOC_037443
TCONS_00074940 lncRNA downstream 48828 51109789 ~ 51133178 (+) True XLOC_037449
TCONS_00075221 lncRNA downstream 76375 51137336 ~ 51141121 (+) False XLOC_037450
TCONS_00075223 lncRNA downstream 76391 51137352 ~ 51141121 (+) False XLOC_037450
TCONS_00075222 lncRNA downstream 76391 51137352 ~ 51141121 (+) True XLOC_037450
TCONS_00075224 lncRNA downstream 704573 51765534 ~ 51775942 (+) True XLOC_037455
TCONS_00073653 mRNA upstream 287786 50600355 ~ 50755669 (+) False XLOC_037444
TCONS_00073652 mRNA upstream 291173 50599362 ~ 50752282 (+) False XLOC_037444
TCONS_00073654 mRNA upstream 291841 50749388 ~ 50751614 (+) True XLOC_037444
TCONS_00073651 mRNA upstream 702735 50316921 ~ 50340720 (+) True XLOC_037442
TCONS_00073650 mRNA upstream 837698 50175366 ~ 50205757 (+) True XLOC_037441
TCONS_00073657 mRNA downstream 86419 51147380 ~ 51217090 (+) False XLOC_037451
TCONS_00073658 mRNA downstream 86803 51147764 ~ 51217396 (+) False XLOC_037451
TCONS_00073659 mRNA downstream 119547 51180508 ~ 51217128 (+) True XLOC_037451
TCONS_00073660 mRNA downstream 164384 51225345 ~ 51261339 (+) True XLOC_037452
TCONS_00073661 mRNA downstream 204322 51265283 ~ 51271597 (+) True XLOC_037453
TCONS_00073655 other upstream 242982 50800357 ~ 50800473 (+) True XLOC_037446
TCONS_00073648 other upstream 953198 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440
TCONS_00073638 other upstream 1258018 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435
TCONS_00073602 other upstream 4612322 46421027 ~ 46431133 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073600 other upstream 5221870 45821469 ~ 45821585 (+) True XLOC_037408
TCONS_00073665 other downstream 1021350 52082311 ~ 52082437 (+) True XLOC_037460
TCONS_00073706 other downstream 4187239 55248200 ~ 55248314 (+) True XLOC_037493
TCONS_00073716 other downstream 4855452 55916413 ~ 55916544 (+) True XLOC_037503

Expression Profile


//