RNA id: TCONS_00073664


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073664
length 1491
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_037457
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 51882534 ~ 51884024 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAGacacaacacgcacacacaaacacacacacatacacccacatGCACAGACAtgacatgcacatacacacacttacatagaTGAGCacacataccacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacccgcacacaaacacacacacttacatacaattgcacacagacacaacacgcacacacacacttgcatacatGTGGACACAGAcacaacacgcgcacacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacatacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacatacacacacacacacttacatacatgtggacacatacacaacacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagaaacaacatacacacacaaacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacacgcacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacactgtcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacccgcacacaaacacacacacttacatacaattgcacacagacacaacacgcacacacacacttgcatacatGTGGACACAGAcacaacacgcgcacacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacatacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacatacacacacacacttacatacatgtggacacatacacaacacacacacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacatacacacacaaacacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacacgcacacacacacttacatacatgtgcacacagacacaacactgtcacacacacacacacacacacacacttacatatgcacacagacacaacatgctcacacaaacacacacacttacacacatgtGGAcacaacatacacaaacacacacacacttacatgtgGACACAGACACaacctgcacacacaaacacacacacttacatacatgtaaacacacacaaacttacatACATATGCACGCTGacacaacatacacatacacttatGGTCACATGTACTTACATGCACAAatacatgacacacacacacacacacacacttacatacataTGCACTCTGACATGACATAAACACATCCATACACATGCGGGCGCGCACACATTCACGCATATACGCATATACACACCACACACTCATGCACAGgtgctcacagacacacacatactcatgtGCACACTTACTTACACATCACACATCATGCATTCATACAGaccctcacacacatacacaaacatacactttcttctacac

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000165493

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075224 lncRNA upstream 106592 51765534 ~ 51775942 (+) True XLOC_037455
TCONS_00075221 lncRNA upstream 741413 51137336 ~ 51141121 (+) False XLOC_037450
TCONS_00075223 lncRNA upstream 741413 51137352 ~ 51141121 (+) False XLOC_037450
TCONS_00075222 lncRNA upstream 741413 51137352 ~ 51141121 (+) True XLOC_037450
TCONS_00074940 lncRNA upstream 749356 51109789 ~ 51133178 (+) True XLOC_037449
TCONS_00075225 lncRNA downstream 72001 51956025 ~ 51957617 (+) True XLOC_037458
TCONS_00075226 lncRNA downstream 78461 51962485 ~ 52006435 (+) True XLOC_037459
TCONS_00075227 lncRNA downstream 502516 52386540 ~ 52402421 (+) False XLOC_037461
TCONS_00075228 lncRNA downstream 744220 52628244 ~ 52629286 (+) True XLOC_037465
TCONS_00075229 lncRNA downstream 1124665 53008689 ~ 53010059 (+) True XLOC_037467
TCONS_00073663 mRNA upstream 77706 51784922 ~ 51804828 (+) True XLOC_037456
TCONS_00073662 mRNA upstream 126776 51655636 ~ 51755758 (+) True XLOC_037454
TCONS_00073661 mRNA upstream 610937 51265283 ~ 51271597 (+) True XLOC_037453
TCONS_00073660 mRNA upstream 621195 51225345 ~ 51261339 (+) True XLOC_037452
TCONS_00073658 mRNA upstream 665138 51147764 ~ 51217396 (+) False XLOC_037451
TCONS_00073666 mRNA downstream 514507 52398531 ~ 52402015 (+) True XLOC_037461
TCONS_00073667 mRNA downstream 527506 52411530 ~ 52446996 (+) True XLOC_037462
TCONS_00073668 mRNA downstream 608615 52492639 ~ 52539704 (+) True XLOC_037463
TCONS_00073669 mRNA downstream 729796 52613820 ~ 52616491 (+) False XLOC_037464
TCONS_00073670 mRNA downstream 729797 52613821 ~ 52624373 (+) False XLOC_037464
TCONS_00073655 other upstream 1082061 50800357 ~ 50800473 (+) True XLOC_037446
TCONS_00073648 other upstream 1792277 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440
TCONS_00073638 other upstream 2097097 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435
TCONS_00073602 other upstream 5451401 46421027 ~ 46431133 (+) False XLOC_037412
TCONS_00073600 other upstream 6060949 45821469 ~ 45821585 (+) True XLOC_037408
TCONS_00073665 other downstream 198287 52082311 ~ 52082437 (+) True XLOC_037460
TCONS_00073706 other downstream 3364176 55248200 ~ 55248314 (+) True XLOC_037493
TCONS_00073716 other downstream 4032389 55916413 ~ 55916544 (+) True XLOC_037503

Expression Profile

//