RNA id: TCONS_00073716



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073716
length 132
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_037503
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 55916413 ~ 55916544 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccctctgtcaagcgttaaCGCTGCAGCCCCGTGTGAATTGGGCGTAAGAGCggttactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtatctggattggagaccacatgggaacactaggatgctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000122025

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075248 lncRNA upstream 9423 55900719 ~ 55906990 (+) True XLOC_037501
TCONS_00075249 lncRNA upstream 11463 55902859 ~ 55904950 (+) True XLOC_037502
TCONS_00075245 lncRNA upstream 29074 55880829 ~ 55887339 (+) False XLOC_037500
TCONS_00075244 lncRNA upstream 29074 55880829 ~ 55887339 (+) False XLOC_037500
TCONS_00075246 lncRNA upstream 29074 55881360 ~ 55887339 (+) False XLOC_037500
TCONS_00075250 lncRNA downstream 405430 56321974 ~ 56323914 (+) True XLOC_037507
TCONS_00073715 mRNA upstream 41336 55857193 ~ 55875077 (+) False XLOC_037499
TCONS_00073711 mRNA upstream 361679 55455801 ~ 55554734 (+) False XLOC_037495
TCONS_00073710 mRNA upstream 361679 55455801 ~ 55554734 (+) False XLOC_037495
TCONS_00073712 mRNA upstream 361679 55536005 ~ 55554734 (+) True XLOC_037495
TCONS_00073708 mRNA upstream 498217 55321322 ~ 55418196 (+) False XLOC_037494
TCONS_00073717 mRNA downstream 186629 56103173 ~ 56172757 (+) True XLOC_037504
TCONS_00073718 mRNA downstream 277866 56194410 ~ 56222014 (+) True XLOC_037505
TCONS_00073719 mRNA downstream 316004 56232548 ~ 56245149 (+) True XLOC_037506
TCONS_00073720 mRNA downstream 505767 56422311 ~ 56426047 (+) False XLOC_037508
TCONS_00073721 mRNA downstream 505973 56422517 ~ 56423344 (+) True XLOC_037508
TCONS_00073706 other upstream 668099 55248200 ~ 55248314 (+) True XLOC_037493
TCONS_00073665 other upstream 3833976 52082311 ~ 52082437 (+) True XLOC_037460
TCONS_00073655 other upstream 5115940 50800357 ~ 50800473 (+) True XLOC_037446
TCONS_00073648 other upstream 5826156 50089000 ~ 50090257 (+) True XLOC_037440
TCONS_00073638 other upstream 6130976 49785320 ~ 49785437 (+) True XLOC_037435